Skip to main content

Table 2 Comparison of gene length, initiation codon and termination codon in Crassostrea mt genomes

From: Unusual conservation of mitochondrial gene order in Crassostreaoysters: evidence for recent speciation in Asia

  Cgi Can Csi Cho Car Cvi Cgi Can Csi Cho Car Cvi Cgi Can Csi Cho Cai Cvi
cox1 538 538 538 538 538 540 ATG ATG ATG ATG ATG ATG TAG TAG TAA TAA TAA TAA
cox2 233 233 233 233 233 230 ATG ATG ATG ATG ATG ATG TAA TAG TAA TAG TAG TAA
cox3 291 291 291 287 287 290 ATG ATG ATG ATG ATG ATA TAG TAA TAG TAA TAA TA-
nad1 311 311 311 311 311 311 ATG ATG ATG ATG ATG ATG TAA TAA TAA TAA TAA TAA
nad2 332 332 332 332 332 331 ATG ATG ATG ATG ATG ATG TAG TAG TAA TAG TAG TAA
nad3 116 116 116 116 116 117 ATG ATG ATG ATG ATG ATG TAG TAG TAG TAG TAA TAA
nad4 450 449 449 449 449 449 ATG ATG ATG ATA ATG ATG TAA TAA TAG TAG TAG TAA
nad4L 94 94 94 93 94 93 ATG ATG ATA ATG ATA ATG T- T- T- T- T- T-
nad5 556 556 557 556 556 555 ATG ATG ATG ATG GTG ATG TAG TAG TAG TAA TAG TAA
nad6 158 158 158 158 159 153 ATG ATG ATG ATT ATG ATG TAG TAG TAG TA- TAA TAA
cob 412 412 411 401 400 403 CTA CTA CTG ATA TTA TTA TAG TAG TAA TAA TAA TAG
atp6 227 227 227 227 224 224 ATG ATG ATG ATG ATG ATG TAA TAA TAG TAG TAG TAA
rrnL 1 * 601 602 602 605 606 748             
rrnL 2 * 713 713 712 712 712 721             
rrnS 1 * 1037 1038 1037 1074 1070 989             
rrnS 2 * 1205 1206 1195 1190 1183 0             
  1. *rrnL 1 and rrnL 2 indicate the two parts of 5' half and 3'half rrnL, respectively; rrnS 1 and rrnS 2 indicate the duplication of rrnS.