Skip to main content

Table 2 Structural features of the 10 new mitochondrial genomes

From: Ten new complete mitochondrial genomes of pulmonates (Mollusca: Gastropoda) and their impact on phylogenetic relationships

 

Auriculinella

bidentata

Myosotella

myosotis

Ovatella

vulcani

Pedipes

pedipes

Peronia

peronii

Salinator

rhamphidia

Succinea

putris

Rhopalocaulis

grandidieri

Trimusculus

reticulatus

Siphonaria

gigas

Total

size

14, 135

14, 215

14, 274

16, 708

13, 968

14, 007

14, 092

14, 523

14, 044

14, 518

%A

25.8

25.2

25.0

28.6

27.1

26.7

33.8

29.3

26.4

24.3

%T

30.9

32.5

29.7

33.7

37.3

35.6

42.9

33.9

34.7

37.2

%C

20.4

20.3

21.6

18.4

15.4

16.9

10.8

19.7

18.2

15.1

%G

22.6

22.0

23.7

19.3

20.3

20.8

12.1

17.1

20.6

23.4

%A+T

56.7

57.7

54.7

62.3

64.4

62.3

76.7

63.2

61.1

61.5

POR

44

46

44

? (397)

54

44

47

42

47

72

rrnL

1, 037

1, 041

1, 057

1, 138

1, 033

1, 025

1, 020

1, 006

1, 057

1, 109

rrnS

704

714

711

786

714

714

755

716

719

755

cob

1, 111 (TTG/T)

1, 110 (TTG/TAG)

1, 110 (TTG/TAA)

1, 108 (TTG/T)

1, 108 (TTG/T)

1, 111 (TTG/T)

1, 107 (TTG/TAG)

1, 068 (TTG/TAG)

1, 110 (TTG/TAA)

1, 125 (TTG/TAA)

cox1

1, 533 (TTG/TAA)

1, 527 (ATG/TAA)

1, 533 (TTG/TAA)

1, 527 (TTG/TAA)

1, 525 (TTG/T)

1, 527 (TTG/TAA)

1, 548 (TTG/TAG)

1, 527 (TTG/TAA)

1, 527 (TTG/TAG)

1, 530 (GTG/TAG)

cox2

687 (TTG/TAG)

669 (GTG/TAA)

666 (TTG/TAG)

681 (GTG/TAA)

666 (TTG/TAA)

664 (GTG/T)

649 (ATG/T)

634 (TTG/T)

666 (TTG/TAA)

672 (GTG/TAA)

cox3

778 (ATG/T)

780 (ATG/TAG)

778 (ATG/T)

780 (GTG/TAG)

804 (ATG/T)

781 (ATG/T)

783 (ATG/TAG)

772 (ATG/T)

778 (ATG/T)

810 (ATG/TAA)

nad1

906 (GTG/TAA)

906 (TTG/TAG)

906 (TTG/TAA)

903 (ATG/TAG)

906 (TTG/TAA)

958 (TTG/T)

916 (TTG/T)

919 (TTG/T)

906 (TTG/TAA)

903 (TTG/TAA)

nad2

945 (ATG/TAG)

948 (ATG/TAG)

942 (CTG/T)

927 (ATG/TAA)

939 (GTG/TAG)

925 (TTG/T)

975 (TTG/TAA)

915 (GTG/TAA)

916 (TTG/T)

942 (ATG/TAA)

nad3

354 (TTG/TAA)

349 (TTG/TAA)

354 (TTG/TAA)

372 (ATG/TAA)

327 (ATT/TAA)

349 (TTG/T)

352 (ATG/T)

351 (GTG/TAA)

357 (ATG/TAG)

361 (ATG/T)

nad4

1, 311 (TTG/TAG)

1, 305 (TTG/TAA)

1, 308 (TTG/TAG)

1, 302 (ATG/TAG)

1, 318 (TTG/T)

1, 311 (TTG/TAG)

1, 326 (ATG/TAA)

1, 308 (ATG/TAA)

1, 306 (TTG/T)

1, 324 (TTG/T)

nad4L

327 (TTG/TAG)

291 (TTG/TAA)

286 (TTG/T)

288 (GTG/TAG)

283 (ATG/T)

279 (TTG/TAG)

275 (ATA/TA)

274 (TTG/T)

286 (ATG/T)

294 (GTG/TAA)

nad5

1, 665 (ATA/TAG)

1, 689 (ATA/TAG)

1, 671 (TTG/TAG)

1, 701 (ATG/TAG)

1, 671 (TTG/TAG)

1, 671 (TTG/TAG)

1, 680 (ATG/TAA)

1, 662 (ATT/TAA)

1, 680 (TTG/TAG)

1, 674 (GTG/TAA)

nad6

483 (ATT/TAA)

477 (TTG/TAA)

480 (ATT/TAG)

462 (TTG/TAA)

468 (ATT/TAA)

474 (TTG/TAA)

453 (ATG/TAA)

450 (ATG/TAG)

456 (TTG/TAG)

489 (ATT/TAG)

atp6

643 (GTG/T)

645 (ATG/TAG)

645 (GTG/TAG)

642 (ATG/TAG)

642 (TTG/TAA)

643 (ATG/T)

657 (ATG/TAA)

618 (ATG/TAA)

643 (ATG/T)

657 (ATG/TAA)

atp8

157 (GTG/T)

153 (ATG/TAG)

159 (ATG/TAG)

153 (ATG/TAA)

153 (ATG/TAA)

151 (ATG/T)

123 (TTG/TAA)

151 (GTG/T)

186 (ATG/TAG)

162 (ATG/TAA)

  1. The size of each genome and the POR are in bp. Start and stop codons for protein-coding genes are indicated in parentheses.