From: The architecture of mammalian ribosomal protein promoters
RP GENE | TATA Quality | % H/M identity in 300 bp ‡ | GABP (5' of tsp) | Sp1 (5' of tsp) | YY1 (3' of tsp) | OTHER (5' of tsp) | AUG †| ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | Hs | Mm |  | H-M | H | H-M | H | H-M | H |  |  |
SA | + | + | 58 | Â | 1 | Â | 2 | 1 | Â | ATF, CREB | E2 |
S2 | + | + | 54 | Â | Â | 1 | 1 | Â | Â | Â | E2 |
S3 | + | + | 60 | 1 | Â | 1 | Â | 1 | Â | Â | E1 |
S3a | – | – | 75 | 2 |  | 1 |  |  |  | AP1 | E1 |
S4 | +/– | +/– | 70 | 1 | 1 | 1 |  |  |  |  | E1e |
S5 | +/– | + | 62 | 1 |  |  |  |  |  |  | E2 |
S6 | – | – | 56 | 3 * |  |  | 1 |  | 1 | Box A * | E1 |
S7 | +/– | + | 56 |  | 4 |  | 2 |  |  | Box A | E2 |
S8 | +/– | +/– | 60 |  |  | 1 |  |  |  |  | E1e |
S9 | + | + | 50 | Â | 1 | Â | Â | 1 | Â | ATF, CREB, AP1 | E2 |
S10 | – | – | 64 | 1 |  | 1 | 1 | 1 |  | Nrf1 | E2 |
S11 | +/– | +/– | 53 | 1 |  | 1 | 1 | 1 |  | Box A, ATF, CREB, AP1 | E1 |
S12 | + | + | 62 | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Nrf1 | E2 |
S13 | – | +/– | 61 |  |  | 1 |  | 1 |  | AP1 | E1 |
S14 | – | – | 62 | 3 * |  | 1 |  |  |  | AP1 | E2 |
S15 | +/– | +/– | 52 | 1 |  | 1 |  | 1 |  | Nrf1 | E1e |
S15a | +/– | +/– | 59 | 1 |  |  |  | 2 | 1 | Box A | E2 |
S16 | – | +/– | 74 |  |  | 2 * | 2 |  |  | Nrf1 | E1 |
S17 | +/– | + | 60 | 1 | 1 |  | 2 |  | 1 |  | E1e |
S18 | + | + | 64 | 3 | Â | 1 | Â | Â | Â | ATF, CREB | E1e |
S19 | +/– | +/– | 72 |  |  | 1 | 1 |  |  | Box A (2) | E2 |
S20 | + | + | 63 | 1 | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | E1e |
S21 | + | +/– | 52 | 3 |  |  | 1 |  |  |  | E2 |
S23 | – | – | 65 | 1 |  | 1 |  | 1 |  |  | E1e |
S24 | + | + | 59 | Â | 1 | Â | 1 | 2 | Â | Â | E1e |
S25 | – | – | 56 | 1 | 1 |  |  |  |  |  | E1e |
S26 | + | + | 53 | Â | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | E1e |
S27 | + | + | 71 | 2 | 1 | Â | Â | 1 | Â | Â | E1 |
S27a | – | – | 57 |  |  | 1 | 1 | 1 |  |  | E2 |
S28 | + | + | 67 | 1 | 1 | Â | 1 | 1 | Â | AP1 | E1 |
S29 | – | – | inc |  |  |  |  |  |  |  | E1 |
S30 | – | – | 68 |  |  | 4 |  | 1 |  | ATF, CREB | E2 |
L3 | + | + | 56 | Â | 2 | 1 | Â | 1 | 1 | Â | E1e |
L4 | + | + | 68 | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | E1e |
L5 | + | + | 62 | Â | Â | Â | 1 | 1 | Â | Â | E1e |
L6 | +/– | +/– | 62 | 1 | 1 |  |  | 1 |  |  | E2 |
L7 | +/– | +/– | 69 | 1 |  |  |  | 1 |  | Nrf1 | E1 |
L7a | + | + | 51 | Â | Â | 2 | 1 | 1 | 1 | Box A*, B | E1e |
L8 | +/– | +/– | 50 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |  | AP1 | E2 |
L9 | – | – | 57 |  |  |  |  |  | 1 | ATF, CREB (2) | E2 |
L10 | + | + | 60 | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | E2 |
L10a | + | + | 55 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Box A, Nrf1 | E1 |
L11 | +/– | +/– | 64 | 1 |  | 1 |  | 1 |  |  | E2 |
L12 | + | + | 73 | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Box A | E1 |
L13 | – | +/– | 55 |  |  |  | 1 | 1 |  |  | E2 |
L13a | +/– | +/– | 67 |  | 2 | 2 |  | 1 |  | ATF, CREB, AP1 | E1 |
L14 | +/– | +/– | 58 |  |  | 2 | 1 |  |  | Nrf1 | E1e |
L15 | – | – | 66 | 1 |  | 1 | 1 | 2 |  |  | E2 |
L17 | – | – | 69 |  | 1 |  |  | 1 | 1 | Box A | E2 |
L18 | – | – | 51 |  |  | 1 |  | 2 |  | ATF, CREB, AP1 | E1e |
L18a | – | – | 67 | 1 |  | 1 |  |  |  |  | E1 |
L19 | +/– | +/– | 65 | 1 | 1 |  |  |  |  |  | E1 |
L21 | – | – | 62 |  |  | 1 |  | 1 |  |  | E2 |
L22 | – | – | 61 |  |  |  |  |  |  |  | E1 |
L23 | + | + | 64 | Â | 1 | 1 | Â | Â | 1 | Â | E1 |
L23a | +/– | +/– | 63 |  |  |  |  | 1 |  | Box A | E1 |
L24 | +/– | +/– | 56 |  | 1 |  |  | 1 |  |  | E1 |
L26 | +/– | +/– | 64 | 1 | 1 |  |  | 2 |  | Box A | E2 |
L27 | – | – | 66 | 3 |  | 1 |  | 1 |  |  | E2 |
L27a | – | – | 56 | 1 |  | 1 | 1 |  |  | Box A | E1e |
L28 | + | +/– | 56 | 2 | 1 |  | 1 | 1 |  |  | E2 |
L29 | +/– | +/– | 68 | 2 |  |  | 1 |  | 1 |  | E1e//2 |
L30 | – | – | 60 | 2 * |  |  | 1 | 1 * |  | RFX1* Gamma* | E2 |
L31 | – | – | 62 | 1 |  | 1 |  |  |  |  | E2 |
L32 | – | – | 68 | 1 * |  |  |  | 1 * | 1 * | Gamma * | E2 |
L34 | – | – | 55 | 1 |  | 1 | 2 | 1 |  |  | E2 |
L35 | – | – | 59 |  |  | 2 | 4 | 1 |  |  | E1e |
L35a | – | – | 64 |  |  | 1 | 1 | 1 |  |  | E2 |
L36 | +/– | + | 51 |  |  |  | 1 |  | 1 |  | E2 |
L36a | + | + | 62 | 1 | Â | 2 | 2 | 1 | Â | Â | E1e |
L37 | + | – | 60 | 2 | 2 | 1 | 1 | 2 |  |  | E1e |
L37a | +/– | +/– | 52 | 1 |  |  |  |  |  | Nrf1 | E1e |
L38 | +/– | – | 62 | 2 |  |  |  |  |  |  | E2 |
L39 | – | +/– | 61 | 1 | 1 |  | 1 | 1 |  |  | E1e |
L40 | – | – | 62 | 2 |  |  | 3 |  |  | ATF, CREB | E2 |
L41 | + | + | 54 | 1 | 1 | 1 | Â | Â | Â | ATF, CREB, AP1 | E2 |
LP0 | + | + | 59 | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | E2 |
LP1 | +/– | +/– | 62 | 1 |  |  |  |  |  |  | E1 |
LP2 | +/– | – | 55 |  |  | 1 |  |  |  |  | E2 |