TY - JOUR AU - Palczewski, K. AU - Kumasaka, T. AU - Hori, T. AU - Behnke, C. A. AU - Motoshima, H. AU - Fox, B. A. AU - Le Trong, I. AU - Teller, D. C. AU - Okada, T. AU - Stenkamp, R. E. AU - Yamamoto, M. AU - Miyano, M. PY - 2000 DA - 2000// TI - Crystal structure of rhodopsin: A G protein-coupled receptor JO - Science VL - 289 UR - https://doi.org/10.1126/science.289.5480.739 DO - 10.1126/science.289.5480.739 ID - Palczewski2000 ER - TY - JOUR AU - Marinissen, M. J. AU - Gutkind, J. S. PY - 2001 DA - 2001// TI - G-protein-coupled receptors and signaling networks: emerging paradigms JO - Trends Pharmacol Sci VL - 22 UR - https://doi.org/10.1016/S0165-6147(00)01678-3 DO - 10.1016/S0165-6147(00)01678-3 ID - Marinissen2001 ER - TY - JOUR AU - Wise, A. AU - Gearing, K. AU - Rees, S. PY - 2002 DA - 2002// TI - Target validation of G-protein coupled receptors JO - Drug Discovery Today VL - 7 UR - https://doi.org/10.1016/S1359-6446(01)02131-6 DO - 10.1016/S1359-6446(01)02131-6 ID - Wise2002 ER - TY - JOUR AU - Flower, D. R. PY - 1999 DA - 1999// TI - Modelling G-protein-coupled receptors for drug design JO - Biochim Biophys Acta VL - 1422 UR - https://doi.org/10.1016/S0304-4157(99)00006-4 DO - 10.1016/S0304-4157(99)00006-4 ID - Flower1999 ER - TY - JOUR AU - Drews, J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Drug discovery: a historical perspective JO - Science VL - 287 UR - https://doi.org/10.1126/science.287.5460.1960 DO - 10.1126/science.287.5460.1960 ID - Drews2000 ER - TY - JOUR AU - Lin, S. H. AU - Civelli, O. PY - 2004 DA - 2004// TI - Orphan G protein-coupled receptors: targets for new therapeutic interventions JO - Ann Med VL - 36 UR - https://doi.org/10.1080/07853890310024668 DO - 10.1080/07853890310024668 ID - Lin2004 ER - TY - CHAP AU - Metpally, R. P. R. AU - Sowdhamini, R. PY - 2004 DA - 2004// TI - Cross Genome Clustering of G-protein Coupled Receptor Sequences [Abstract] BT - Proceedings of the International Conference on Mathematical Biology: 19-21 Feb 2004; Kanpur; ID - Metpally2004 ER - TY - JOUR AU - Marchese, A. AU - George, S. R. AU - Kolakowski, L. F. J. AU - Lynch, K. R. AU - O'Dowd, B. F. PY - 1999 DA - 1999// TI - Novel GPCRs and their endogenous ligands: expanding the boundaries of physiology and pharmacology JO - Trends Pharmacol Sci VL - 20 UR - https://doi.org/10.1016/S0165-6147(99)01366-8 DO - 10.1016/S0165-6147(99)01366-8 ID - Marchese1999 ER - TY - JOUR AU - Meeusen, T. AU - Mertens, I. AU - De Loof, A. AU - Schoofs, L. PY - 2003 DA - 2003// TI - G protein-coupled receptors in invertebrates: a state of the art JO - Int Rev Cytol VL - 230 UR - https://doi.org/10.1016/S0074-7696(03)30004-X DO - 10.1016/S0074-7696(03)30004-X ID - Meeusen2003 ER - TY - JOUR AU - Herz, J. M. AU - Thomsen, W. J. AU - Yarbrough, G. G. PY - 1997 DA - 1997// TI - Molecular approaches to receptors as targets for drug discovery JO - J Recept Signal Transduct Res VL - 17 UR - https://doi.org/10.3109/10799899709044284 DO - 10.3109/10799899709044284 ID - Herz1997 ER - TY - JOUR AU - Attwood, T. K. PY - 2001 DA - 2001// TI - A compendium of specific motifs for diagnosing GPCR subtypes JO - Trends Pharmacol Sci VL - 22 UR - https://doi.org/10.1016/S0165-6147(00)01658-8 DO - 10.1016/S0165-6147(00)01658-8 ID - Attwood2001 ER - TY - JOUR AU - Lindemann, L. AU - Ebeling, M. AU - Kratochwil, N. A. AU - Bunzow, J. R. AU - Grandy, D. K. AU - Hoener, M. C. PY - 2005 DA - 2005// TI - Trace amine-associated receptors form structurally and functionally distinct subfamilies of novel G protein-coupled receptors JO - Genomics VL - 85 UR - https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2004.11.010 DO - 10.1016/j.ygeno.2004.11.010 ID - Lindemann2005 ER - TY - JOUR AU - Bjarnadottir, T. K. AU - Schioth, H. B. AU - Fredriksson, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - The phylogenetic relationship of the glutamate and pheromone g-protein-coupled receptors in different vertebrate species JO - Ann N Y Acad Sci VL - 1040 UR - https://doi.org/10.1196/annals.1327.031 DO - 10.1196/annals.1327.031 ID - Bjarnadottir2005 ER - TY - JOUR AU - Jaillon, O. AU - Aury, J. M. AU - Brunet, F. AU - Petit, J. L. AU - Stange-Thomann, N. AU - Mauceli, E. AU - Bouneau, L. AU - Fischer, C. AU - Ozouf-Costaz, C. AU - Bernot, A. AU - Nicaud, S. AU - Jaffe, D. AU - Fisher, S. AU - Lutfalla, G. AU - Dossat, C. AU - Segurens, B. AU - Dasilva, C. AU - Salanoubat, M. AU - Levy, M. AU - Boudet, N. AU - Castellano, S. AU - Anthouard, V. AU - Jubin, C. AU - Castelli, V. AU - Katinka, M. AU - Vacherie, B. AU - Biemont, C. AU - Skalli, Z. AU - Cattolico, L. AU - Poulain, J. AU - De Berardinis, V. AU - Cruaud, C. AU - Duprat, S. AU - Brottier, P. AU - Coutanceau, J. P. AU - Gouzy, J. AU - Parra, G. AU - Lardier, G. AU - Chapple, C. AU - McKernan, K. J. AU - McEwan, P. AU - Bosak, S. AU - Kellis, M. AU - Volff, J. N. AU - Guigo, R. AU - Zody, M. C. AU - Mesirov, J. AU - Lindblad-Toh, K. AU - Birren, B. AU - Nusbaum, C. AU - Kahn, D. AU - Robinson-Rechavi, M. AU - Laudet, V. AU - Schachter, V. AU - Quetier, F. AU - Saurin, W. AU - Scarpelli, C. AU - Wincker, P. AU - Lander, E. S. AU - Weissenbach, J. AU - Roest Crollius, H. PY - 2004 DA - 2004// TI - Genome duplication in the teleost fish Tetraodon nigroviridis reveals the early vertebrate proto-karyotype JO - Nature VL - 431 UR - https://doi.org/10.1038/nature03025 DO - 10.1038/nature03025 ID - Jaillon2004 ER - TY - JOUR AU - Brenner, S. AU - Elgar, G. AU - Sandford, R. AU - Macrae, A. AU - Venkatesh, B. AU - Aparicio, S. PY - 1993 DA - 1993// TI - Characterization of the pufferfish (Fugu) genome as a compact model vertebrate genome JO - Nature VL - 366 UR - https://doi.org/10.1038/366265a0 DO - 10.1038/366265a0 ID - Brenner1993 ER - TY - JOUR AU - Roest Crollius, H. AU - Jaillon, O. AU - Bernot, A. AU - Dasilva, C. AU - Bouneau, L. AU - Fischer, C. AU - Fizames, C. AU - Wincker, P. AU - Brottier, P. AU - Quetier, F. AU - Saurin, W. AU - Weissenbach, J. PY - 2000 DA - 2000// TI - Estimate of human gene number provided by genome-wide analysis using Tetraodon nigroviridis DNA sequence JO - Nat Genet VL - 25 UR - https://doi.org/10.1038/76118 DO - 10.1038/76118 ID - Roest Crollius2000 ER - TY - JOUR AU - Venter, J. C. AU - Adams, M. D. AU - Myers, E. W. AU - Li, P. W. AU - Mural, R. J. AU - Sutton, G. G. AU - Smith, H. O. AU - Yandell, M. AU - Evans, C. A. AU - Holt, R. A. AU - Gocayne, J. D. AU - Amanatides, P. AU - Ballew, R. M. AU - Huson, D. H. AU - Wortman, J. R. AU - Zhang, Q. AU - Kodira, C. D. AU - Zheng, X. H. AU - Chen, L. AU - Skupski, M. AU - Subramanian, G. AU - Thomas, P. D. AU - Zhang, J. AU - Gabor Miklos, G. L. AU - Nelson, C. AU - Broder, S. AU - Clark, A. G. AU - Nadeau, J. AU - McKusick, V. A. AU - Zinder, N. AU - Levine, A. J. AU - Roberts, R. J. AU - Simon, M. AU - Slayman, C. AU - Hunkapiller, M. AU - Bolanos, R. AU - Delcher, A. AU - Dew, I. AU - Fasulo, D. AU - Flanigan, M. AU - Florea, L. AU - Halpern, A. AU - Hannenhalli, S. AU - Kravitz, S. AU - Levy, S. AU - Mobarry, C. AU - Reinert, K. AU - Remington, K. AU - Abu-Threideh, J. AU - Beasley, E. AU - Biddick, K. AU - Bonazzi, V. AU - Brandon, R. AU - Cargill, M. AU - Chandramouliswaran, I. AU - Charlab, R. AU - Chaturvedi, K. AU - Deng, Z. AU - Di Francesco, V. AU - Dunn, P. AU - Eilbeck, K. AU - Evangelista, C. AU - Gabrielian, A. E. AU - Gan, W. AU - Ge, W. AU - Gong, F. AU - Gu, Z. AU - Guan, P. AU - Heiman, T. J. AU - Higgins, M. E. AU - Ji, R. R. AU - Ke, Z. AU - Ketchum, K. A. AU - Lai, Z. AU - Lei, Y. AU - Li, Z. AU - Li, J. AU - Liang, Y. AU - Lin, X. AU - Lu, F. AU - Merkulov, G. V. AU - Milshina, N. AU - Moore, H. M. AU - Naik, A. K. AU - Narayan, V. A. AU - Neelam, B. AU - Nusskern, D. AU - Rusch, D. B. AU - Salzberg, S. AU - Shao, W. AU - Shue, B. AU - Sun, J. AU - Wang, Z. AU - Wang, A. AU - Wang, X. AU - Wang, J. AU - Wei, M. AU - Wides, R. AU - Xiao, C. AU - Yan, C. AU - Yao, A. AU - Ye, J. AU - Zhan, M. AU - Zhang, W. AU - Zhang, H. AU - Zhao, Q. AU - Zheng, L. AU - Zhong, F. AU - Zhong, W. AU - Zhu, S. AU - Zhao, S. AU - Gilbert, D. AU - Baumhueter, S. AU - Spier, G. AU - Carter, C. AU - Cravchik, A. AU - Woodage, T. AU - Ali, F. AU - An, H. AU - Awe, A. AU - Baldwin, D. AU - Baden, H. AU - Barnstead, M. AU - Barrow, I. AU - Beeson, K. AU - Busam, D. AU - Carver, A. AU - Center, A. AU - Cheng, M. L. AU - Curry, L. AU - Danaher, S. AU - Davenport, L. AU - Desilets, R. AU - Dietz, S. AU - Dodson, K. AU - Doup, L. AU - Ferriera, S. AU - Garg, N. AU - Gluecksmann, A. AU - Hart, B. AU - Haynes, J. AU - Haynes, C. AU - Heiner, C. AU - Hladun, S. AU - Hostin, D. AU - Houck, J. AU - Howland, T. AU - Ibegwam, C. AU - Johnson, J. AU - Kalush, F. AU - Kline, L. AU - Koduru, S. AU - Love, A. AU - Mann, F. AU - May, D. AU - McCawley, S. AU - McIntosh, T. AU - McMullen, I. AU - Moy, M. AU - Moy, L. AU - Murphy, B. AU - Nelson, K. AU - Pfannkoch, C. AU - Pratts, E. AU - Puri, V. AU - Qureshi, H. AU - Reardon, M. AU - Rodriguez, R. AU - Rogers, Y. H. AU - Romblad, D. AU - Ruhfel, B. AU - Scott, R. AU - Sitter, C. AU - Smallwood, M. AU - Stewart, E. AU - Strong, R. AU - Suh, E. AU - Thomas, R. AU - Tint, N. N. AU - Tse, S. AU - Vech, C. AU - Wang, G. AU - Wetter, J. AU - Williams, S. AU - Williams, M. AU - Windsor, S. AU - Winn-Deen, E. AU - Wolfe, K. AU - Zaveri, J. AU - Zaveri, K. AU - Abril, J. F. AU - Guigo, R. AU - Campbell, M. J. AU - Sjolander, K. V. AU - Karlak, B. AU - Kejariwal, A. AU - Mi, H. AU - Lazareva, B. AU - Hatton, T. AU - Narechania, A. AU - Diemer, K. AU - Muruganujan, A. AU - Guo, N. AU - Sato, S. AU - Bafna, V. AU - Istrail, S. AU - Lippert, R. AU - Schwartz, R. AU - Walenz, B. AU - Yooseph, S. AU - Allen, D. AU - Basu, A. AU - Baxendale, J. AU - Blick, L. AU - Caminha, M. AU - Carnes-Stine, J. AU - Caulk, P. AU - Chiang, Y. H. AU - Coyne, M. AU - Dahlke, C. AU - Mays, A. AU - Dombroski, M. AU - Donnelly, M. AU - Ely, D. AU - Esparham, S. AU - Fosler, C. AU - Gire, H. AU - Glanowski, S. AU - Glasser, K. AU - Glodek, A. AU - Gorokhov, M. AU - Graham, K. AU - Gropman, B. AU - Harris, M. AU - Heil, J. AU - Henderson, S. AU - Hoover, J. AU - Jennings, D. AU - Jordan, C. AU - Jordan, J. AU - Kasha, J. AU - Kagan, L. AU - Kraft, C. AU - Levitsky, A. AU - Lewis, M. AU - Liu, X. AU - Lopez, J. AU - Ma, D. AU - Majoros, W. AU - McDaniel, J. AU - Murphy, S. AU - Newman, M. AU - Nguyen, T. AU - Nguyen, N. AU - Nodell, M. AU - Pan, S. AU - Peck, J. AU - Peterson, M. AU - Rowe, W. AU - Sanders, R. AU - Scott, J. AU - Simpson, M. AU - Smith, T. AU - Sprague, A. AU - Stockwell, T. AU - Turner, R. AU - Venter, E. AU - Wang, M. AU - Wen, M. AU - Wu, D. AU - Wu, M. AU - Xia, A. AU - Zandieh, A. AU - Zhu, X. PY - 2001 DA - 2001// TI - The sequence of the human genome JO - Science VL - 291 UR - https://doi.org/10.1126/science.1058040 DO - 10.1126/science.1058040 ID - Venter2001 ER - TY - JOUR AU - Hill, C. A. AU - Fox, A. N. AU - Pitts, R. J. AU - Kent, L. B. AU - Tan, P. L. AU - Chrystal, M. A. AU - Cravchik, A. AU - Collins, F. H. AU - Robertson, H. M. AU - Zwiebel, L. J. PY - 2002 DA - 2002// TI - G protein-coupled receptors in Anopheles gambiae JO - Science VL - 298 UR - https://doi.org/10.1126/science.1076196 DO - 10.1126/science.1076196 ID - Hill2002 ER - TY - JOUR AU - Fredriksson, R. AU - Schioth, H. B. PY - 2005 DA - 2005// TI - The repertoire of G-protein-coupled receptors in fully sequenced genomes JO - Mol Pharmacol VL - 67 UR - https://doi.org/10.1124/mol.104.009001 DO - 10.1124/mol.104.009001 ID - Fredriksson2005 ER - TY - JOUR AU - Gloriam, D. E. AU - Bjarnadottir, T. K. AU - Yan, Y. L. AU - Postlethwait, J. H. AU - Schioth, H. B. AU - Fredriksson, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - The repertoire of trace amine G-protein-coupled receptors: large expansion in zebrafish JO - Mol Phylogenet Evol VL - 35 UR - https://doi.org/10.1016/j.ympev.2004.12.003 DO - 10.1016/j.ympev.2004.12.003 ID - Gloriam2005 ER - TY - JOUR AU - Taylor, J. S. AU - Braasch, I. AU - Frickey, T. AU - Meyer, A. AU - Van de Peer, Y. PY - 2003 DA - 2003// TI - Genome duplication, a trait shared by 22000 species of ray-finned fish JO - Genome Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1101/gr.640303 DO - 10.1101/gr.640303 ID - Taylor2003 ER - TY - JOUR AU - Van de Peer, Y. PY - 2004 DA - 2004// TI - Tetraodon genome confirms Takifugu findings: most fish are ancient polyploids JO - Genome Biol VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2004-5-12-250 DO - 10.1186/gb-2004-5-12-250 ID - Van de Peer2004 ER - TY - JOUR AU - Fredriksson, R. AU - Lagerstrom, M. C. AU - Lundin, L. G. AU - Schioth, H. B. PY - 2003 DA - 2003// TI - The G-protein-coupled receptors in the human genome form five main families. Phylogenetic analysis, paralogon groups, and fingerprints JO - Mol Pharmacol VL - 63 UR - https://doi.org/10.1124/mol.63.6.1256 DO - 10.1124/mol.63.6.1256 ID - Fredriksson2003 ER - TY - JOUR AU - Schioth, H. B. AU - Fredriksson, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - The GRAFS classification system of G-protein coupled receptors in comparative perspective JO - Gen Comp Endocrinol VL - 142 UR - https://doi.org/10.1016/j.ygcen.2004.12.018 DO - 10.1016/j.ygcen.2004.12.018 ID - Schioth2005 ER - TY - JOUR AU - Fredriksson, R. AU - Lagerstrom, M. C. AU - Schioth, H. B. PY - 2005 DA - 2005// TI - Expansion of the superfamily of g-protein-coupled receptors in chordates JO - Ann N Y Acad Sci VL - 1040 UR - https://doi.org/10.1196/annals.1327.011 DO - 10.1196/annals.1327.011 ID - Fredriksson2005 ER - TY - JOUR AU - Kratz, E. AU - Dugas, J. C. AU - Ngai, J. PY - 2002 DA - 2002// TI - Odorant receptor gene regulation: implications from genomic organization JO - Trends Genet VL - 18 UR - https://doi.org/10.1016/S0168-9525(01)02579-3 DO - 10.1016/S0168-9525(01)02579-3 ID - Kratz2002 ER - TY - JOUR AU - Li, X. AU - Staszewski, L. AU - Xu, H. AU - Durick, K. AU - Zoller, M. AU - Adler, E. PY - 2002 DA - 2002// TI - Human receptors for sweet and umami taste JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 99 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.072090199 DO - 10.1073/pnas.072090199 ID - Li2002 ER - TY - JOUR AU - Zhao, G. Q. AU - Zhang, Y. AU - Hoon, M. A. AU - Chandrashekar, J. AU - Erlenbach, I. AU - Ryba, N. J. AU - Zuker, C. S. PY - 2003 DA - 2003// TI - The receptors for mammalian sweet and umami taste JO - Cell VL - 115 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(03)00844-4 DO - 10.1016/S0092-8674(03)00844-4 ID - Zhao2003 ER - TY - STD TI - Tetraodon Genome Browser, http://www.genoscope.cns.fr/externe/tetranew/. 2004 ID - ref29 ER - TY - JOUR AU - Horn, F. AU - Weare, J. AU - Beukers, M. W. AU - Horsch, S. AU - Bairoch, A. AU - Chen, W. AU - Edvardsen, O. AU - Campagne, F. AU - Vriend, G. PY - 1998 DA - 1998// TI - GPCRDB: an information system for G protein-coupled receptors JO - Nucleic Acids Res VL - 26 UR - https://doi.org/10.1093/nar/26.1.275 DO - 10.1093/nar/26.1.275 ID - Horn1998 ER - TY - CHAP AU - Metpally, R. P. R. AU - Sowdhamini, R. PY - 2003 DA - 2003// TI - Genome wide survey of Drosophila G protein-coupled receptors [Abstract] BT - Proceedings of the European Conference on Computational Biology in conjunction with the French National Conference on Bioinformatics ID - Metpally2003 ER - TY - JOUR AU - Marchler-Bauer, A. AU - Anderson, J. B. AU - DeWeese-Scott, C. AU - Fedorova, N. D. AU - Geer, L. Y. AU - He, S. AU - Hurwitz, D. I. AU - Jackson, J. D. AU - Jacobs, A. R. AU - Lanczycki, C. J. AU - Liebert, C. A. AU - Liu, C. AU - Madej, T. AU - Marchler, G. H. AU - Mazumder, R. AU - Nikolskaya, A. N. AU - Panchenko, A. R. AU - Rao, B. S. AU - Shoemaker, B. A. AU - Simonyan, V. AU - Song, J. S. AU - Thiessen, P. A. AU - Vasudevan, S. AU - Wang, Y. AU - Yamashita, R. A. AU - Yin, J. J. AU - Bryant, S. H. PY - 2003 DA - 2003// TI - CDD: a curated Entrez database of conserved domain alignments JO - Nucleic Acids Res VL - 31 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkg087 DO - 10.1093/nar/gkg087 ID - Marchler-Bauer2003 ER - TY - JOUR AU - Marchler-Bauer, A. AU - Anderson, J. B. AU - Cherukuri, P. F. AU - DeWeese-Scott, C. AU - Geer, L. Y. AU - Gwadz, M. AU - He, S. AU - Hurwitz, D. I. AU - Jackson, J. D. AU - Ke, Z. AU - Lanczycki, C. J. AU - Liebert, C. A. AU - Liu, C. AU - Lu, F. AU - Marchler, G. H. AU - Mullokandov, M. AU - Shoemaker, B. A. AU - Simonyan, V. AU - Song, J. S. AU - Thiessen, P. A. AU - Yamashita, R. A. AU - Yin, J. J. AU - Zhang, D. AU - Bryant, S. H. PY - 2005 DA - 2005// TI - CDD: a Conserved Domain Database for protein classification JO - Nucleic Acids Res VL - 33 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gki069 DO - 10.1093/nar/gki069 ID - Marchler-Bauer2005 ER - TY - JOUR AU - Letunic, I. AU - Copley, R. R. AU - Schmidt, S. AU - Ciccarelli, F. D. AU - Doerks, T. AU - Schultz, J. AU - Ponting, C. P. AU - Bork, P. PY - 2004 DA - 2004// TI - SMART 4.0: towards genomic data integration JO - Nucleic Acids Res VL - 32 Database issue UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkh088 DO - 10.1093/nar/gkh088 ID - Letunic2004 ER - TY - JOUR AU - Bateman, A. AU - Coin, L. AU - Durbin, R. AU - Finn, R. D. AU - Hollich, V. AU - Griffiths-Jones, S. AU - Khanna, A. AU - Marshall, M. AU - Moxon, S. AU - Sonnhammer, E. L. AU - Studholme, D. J. AU - Yeats, C. AU - Eddy, S. R. PY - 2004 DA - 2004// TI - The Pfam protein families database JO - Nucleic Acids Res VL - 32 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkh121 DO - 10.1093/nar/gkh121 ID - Bateman2004 ER - TY - JOUR AU - Eddy, S. R. PY - 1998 DA - 1998// TI - Profile hidden Markov models JO - Bioinformatics VL - 14 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/14.9.755 DO - 10.1093/bioinformatics/14.9.755 ID - Eddy1998 ER - TY - JOUR AU - Altschul, S. F. AU - Madden, T. L. AU - Schaffer, A. A. AU - Zhang, J. AU - Zhang, Z. AU - Miller, W. AU - Lipman, D. J. PY - 1997 DA - 1997// TI - Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs JO - Nucleic Acids Res VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/nar/25.17.3389 DO - 10.1093/nar/25.17.3389 ID - Altschul1997 ER - TY - JOUR AU - Tusnady, G. E. AU - Simon, I. PY - 2001 DA - 2001// TI - The HMMTOP transmembrane topology prediction server JO - Bioinformatics VL - 17 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/17.9.849 DO - 10.1093/bioinformatics/17.9.849 ID - Tusnady2001 ER - TY - JOUR AU - Hirokawa, T. AU - Boon-Chieng, S. AU - Mitaku, S. PY - 1998 DA - 1998// TI - SOSUI: classification and secondary structure prediction system for membrane proteins JO - Bioinformatics VL - 14 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/14.4.378 DO - 10.1093/bioinformatics/14.4.378 ID - Hirokawa1998 ER - TY - JOUR AU - Jones, D. T. AU - Taylor, W. R. AU - Thornton, J. M. PY - 1994 DA - 1994// TI - A model recognition approach to the prediction of all-helical membrane protein structure and topology JO - Biochemistry VL - 33 UR - https://doi.org/10.1021/bi00176a037 DO - 10.1021/bi00176a037 ID - Jones1994 ER - TY - JOUR AU - Krogh, A. AU - Larsson, B. AU - von Heijne, G. AU - Sonnhammer, E. L. PY - 2001 DA - 2001// TI - Predicting transmembrane protein topology with a hidden Markov model: application to complete genomes JO - J Mol Biol VL - 305 UR - https://doi.org/10.1006/jmbi.2000.4315 DO - 10.1006/jmbi.2000.4315 ID - Krogh2001 ER - TY - JOUR AU - Li, W. AU - Jaroszewski, L. AU - Godzik, A. PY - 2001 DA - 2001// TI - Clustering of highly homologous sequences to reduce the size of large protein databases JO - Bioinformatics VL - 17 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/17.3.282 DO - 10.1093/bioinformatics/17.3.282 ID - Li2001 ER - TY - JOUR AU - Baldauf, S. L. PY - 2003 DA - 2003// TI - Phylogeny for the faint of heart: a tutorial JO - Trends Genet VL - 19 UR - https://doi.org/10.1016/S0168-9525(03)00112-4 DO - 10.1016/S0168-9525(03)00112-4 ID - Baldauf2003 ER - TY - JOUR AU - Thompson, J. D. AU - Gibson, T. J. AU - Plewniak, F. AU - Jeanmougin, F. AU - Higgins, D. G. PY - 1997 DA - 1997// TI - The CLUSTAL_X windows interface: flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools JO - Nucleic Acids Res VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/nar/25.24.4876 DO - 10.1093/nar/25.24.4876 ID - Thompson1997 ER - TY - JOUR AU - Felsenstein, J. PY - 1989 DA - 1989// TI - PHYLIP -- Phylogeny Inference Package (Version 3.2) JO - Cladistics VL - 5 ID - Felsenstein1989 ER - TY - JOUR AU - Page, R. D. PY - 1996 DA - 1996// TI - TreeView: an application to display phylogenetic trees on personal computers JO - Comput Appl Biosci VL - 12 ID - Page1996 ER - TY - JOUR AU - Schmidt, H. A. AU - Strimmer, K. AU - Vingron, M. AU - von Haeseler, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - TREE-PUZZLE: maximum likelihood phylogenetic analysis using quartets and parallel computing JO - Bioinformatics VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/18.3.502 DO - 10.1093/bioinformatics/18.3.502 ID - Schmidt2002 ER -