TY - JOUR AU - Redi, C. A. AU - Garagna, S. AU - Zacharias, H. AU - Zuccotti, M. AU - Capanna, E. PY - 2001 DA - 2001// TI - The other chromatin JO - Chromosoma VL - 110 UR - https://doi.org/10.1007/s004120000114 DO - 10.1007/s004120000114 ID - Redi2001 ER - TY - JOUR AU - Bongiorni, S. AU - Prantera, G. PY - 2003 DA - 2003// TI - Imprinted facultative heterochromatization in mealybugs JO - Genetica VL - 117 UR - https://doi.org/10.1023/A:1022964700446 DO - 10.1023/A:1022964700446 ID - Bongiorni2003 ER - TY - JOUR AU - Chadwick, B. P. AU - Willard, H. F. PY - 2004 DA - 2004// TI - Multiple spatially distinct types of facultative heterochromatin on the human inactive X chromosome JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 101 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0408021101 DO - 10.1073/pnas.0408021101 ID - Chadwick2004 ER - TY - JOUR AU - Schotta, G. AU - Ebert, A. AU - Krauss, V. AU - Fischer, A. AU - Hoffmann, J. AU - Rea, S. AU - Jenuwein, T. AU - Dorn, R. AU - Reuter, G. PY - 2002 DA - 2002// TI - Central role of Drosophila SU(VAR)3-9 in histone H3-K9 methylation and heterochromatic gene silencing JO - EMBO J VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/emboj/21.5.1121 DO - 10.1093/emboj/21.5.1121 ID - Schotta2002 ER - TY - JOUR AU - Mellone, B. G. AU - Ball, L. AU - Suka, N. AU - Grunstein, M. R. AU - Partridge, J. F. AU - Allshire, R. C. PY - 2003 DA - 2003// TI - Centromere silencing and function in fission yeast is governed by the amino terminus of histone H3 JO - Curr Biol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1016/j.cub.2003.09.031 DO - 10.1016/j.cub.2003.09.031 ID - Mellone2003 ER - TY - JOUR AU - Ebert, A. AU - Schotta, G. AU - Lein, S. AU - Kubicek, S. AU - Krauss, V. AU - Jenuwein, T. AU - Reuter, G. PY - 2004 DA - 2004// TI - Su(var) genes regulate the balance between euchromatin and heterochromatin in Drosophila JO - Genes Dev VL - 18 UR - https://doi.org/10.1101/gad.323004 DO - 10.1101/gad.323004 ID - Ebert2004 ER - TY - JOUR AU - Naumann, K. AU - Fischer, A. AU - Hofmann, I. AU - Krauss, V. AU - Phalke, S. AU - Irmler, K. AU - Hause, G. AU - Aurich, A. C. AU - Dorn, R. AU - Jenuwein, T. AU - Reuter, G. PY - 2005 DA - 2005// TI - Pivotal role of AtSUVH2 in heterochromatic histone methylation and gene silencing in Arabidopsis JO - EMBO J VL - 24 UR - https://doi.org/10.1038/sj.emboj.7600604 DO - 10.1038/sj.emboj.7600604 ID - Naumann2005 ER - TY - JOUR AU - Schotta, G. AU - Ebert, A. AU - Reuter, G. PY - 2003 DA - 2003// TI - SU(VAR)3-9 is a conserved key function in heterochromatic gene silencing JO - Genetica VL - 117 UR - https://doi.org/10.1023/A:1022923508198 DO - 10.1023/A:1022923508198 ID - Schotta2003 ER - TY - JOUR AU - Tschiersch, B. AU - Hofmann, A. AU - Krauss, V. AU - Dorn, R. AU - Korge, G. AU - Reuter, G. PY - 1994 DA - 1994// TI - The protein encoded by the Drosophila position-effect variegation suppressor gene Su(var)3-9 combines domains of antagonistic regulators of homeotic gene complexes JO - EMBO J VL - 13 ID - Tschiersch1994 ER - TY - JOUR AU - Krauss, V. AU - Reuter, G. PY - 2000 DA - 2000// TI - Two genes become one: the genes encoding heterochromatin protein Su(var)3-9 and translation initiation factor subunit eIF-2gamma are joined to a dicistronic unit in holometabolic insects JO - Genetics VL - 156 ID - Krauss2000 ER - TY - JOUR AU - Kapp, L. D. AU - Lorsch, J. R. PY - 2004 DA - 2004// TI - The molecular mechanics of eukaryotic translation JO - Annu Rev Biochem VL - 73 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.biochem.73.030403.080419 DO - 10.1146/annurev.biochem.73.030403.080419 ID - Kapp2004 ER - TY - STD TI - FlyBase. A Database of the Drosophila Genome. [http://flybase.org/] UR - http://flybase.org/ ID - ref12 ER - TY - JOUR AU - Aagaard, L. AU - Laible, G. AU - Selenko, P. AU - Schmid, M. AU - Dorn, R. AU - Schotta, G. AU - Kuhfittig, S. AU - Wolf, A. AU - Lebersorger, A. AU - Singh, P. B. AU - Reuter, G. AU - Jenuwein, T. PY - 1999 DA - 1999// TI - Functional mammalian homologues of the Drosophila PEV-modifier Su(var)3-9 encode centromere-associated proteins which complex with the heterochromatin component M31 JO - EMBO J VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/emboj/18.7.1923 DO - 10.1093/emboj/18.7.1923 ID - Aagaard1999 ER - TY - JOUR AU - O'Carroll, D. AU - Scherthan, H. AU - Peters, A. H. AU - Opravil, S. AU - Haynes, A. R. AU - Laible, G. AU - Rea, S. AU - Schmid, M. AU - Lebersorger, A. AU - Jerratsch, M. AU - Sattler, L. AU - Mattei, M. G. AU - Denny, P. AU - Brown, S. D. AU - Schweizer, D. AU - Jenuwein, T. PY - 2000 DA - 2000// TI - Isolation and characterization of Suv39h2, a second histone H3 methyltransferase gene that displays testis-specific expression JO - Mol Cell Biol VL - 20 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.20.24.9423-9433.2000 DO - 10.1128/MCB.20.24.9423-9433.2000 ID - O'Carroll2000 ER - TY - JOUR AU - Baumbusch, L. O. AU - Thorstensen, T. AU - Krauss, V. AU - Fischer, A. AU - Naumann, K. AU - Assalkhou, R. AU - Schulz, I. AU - Reuter, G. AU - Aalen, R. B. PY - 2001 DA - 2001// TI - The Arabidopsis thaliana genome contains at least 29 active genes encoding SET domain proteins that can be assigned to four evolutionarily conserved classes JO - Nucleic Acids Res VL - 29 UR - https://doi.org/10.1093/nar/29.21.4319 DO - 10.1093/nar/29.21.4319 ID - Baumbusch2001 ER - TY - JOUR AU - Brehm, A. AU - Tufteland, K. R. AU - Aasland, R. AU - Becker, P. B. PY - 2004 DA - 2004// TI - The many colours of chromodomains JO - Bioessays VL - 26 UR - https://doi.org/10.1002/bies.10392 DO - 10.1002/bies.10392 ID - Brehm2004 ER - TY - JOUR AU - Citterio, E. AU - Papait, R. AU - Nicassio, F. AU - Vecchi, M. AU - Gomiero, P. AU - Mantovani, R. AU - Di Fiore, P. P. AU - Bonapace, I. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Np95 is a histone-binding protein endowed with ubiquitin ligase activity JO - Mol Cell Biol VL - 24 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.24.6.2526-2535.2004 DO - 10.1128/MCB.24.6.2526-2535.2004 ID - Citterio2004 ER - TY - JOUR AU - Schmitt, E. AU - Blanquet, S. AU - Mechulam, Y. PY - 2002 DA - 2002// TI - The large subunit of initiation factor aIF2 is a close structural homologue of elongation factors JO - EMBO J VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/emboj/21.7.1821 DO - 10.1093/emboj/21.7.1821 ID - Schmitt2002 ER - TY - JOUR AU - Krauss, V. AU - Pecyna, M. AU - Kurz, K. AU - Sass, H. PY - 2005 DA - 2005// TI - Phylogenetic mapping of intron positions: a case study of translation initiation factor eIF2gamma JO - Mol Biol Evol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msh255 DO - 10.1093/molbev/msh255 ID - Krauss2005 ER - TY - JOUR AU - Eskeland, R. AU - Czermin, B. AU - Boeke, J. AU - Bonaldi, T. AU - Regula, J. T. AU - Imhof, A. PY - 2004 DA - 2004// TI - The N-terminus of Drosophila SU(VAR)3-9 mediates dimerization and regulates its methyltransferase activity JO - Biochemistry VL - 43 UR - https://doi.org/10.1021/bi035964s DO - 10.1021/bi035964s ID - Eskeland2004 ER - TY - JOUR AU - Delattre, M. AU - Spierer, A. AU - Jaquet, Y. AU - Spierer, P. PY - 2004 DA - 2004// TI - Increased expression of Drosophila Su(var)3-7 triggers Su(var)3-9-dependent heterochromatin formation JO - J Cell Sci VL - 117 UR - https://doi.org/10.1242/jcs.01549 DO - 10.1242/jcs.01549 ID - Delattre2004 ER - TY - JOUR AU - Rost, B. AU - Yachdav, G. AU - Liu, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - The PredictProtein Server JO - Nucleic Acids Res VL - 32 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkh377 DO - 10.1093/nar/gkh377 ID - Rost2004 ER - TY - JOUR AU - Wootton, J. C. AU - Federhen, S. PY - 1996 DA - 1996// TI - Analysis of compositionally biased regions in sequence databases JO - Methods Enzymol VL - 266 UR - https://doi.org/10.1016/S0076-6879(96)66035-2 DO - 10.1016/S0076-6879(96)66035-2 ID - Wootton1996 ER - TY - JOUR AU - Ivanova, A. V. AU - Bonaduce, M. J. AU - Ivanov, S. V. AU - Klar, A. J. PY - 1998 DA - 1998// TI - The chromo and SET domains of the Clr4 protein are essential for silencing in fission yeast JO - Nat Genet VL - 19 UR - https://doi.org/10.1038/566 DO - 10.1038/566 ID - Ivanova1998 ER - TY - JOUR AU - Melcher, M. AU - Schmid, M. AU - Aagaard, L. AU - Selenko, P. AU - Laible, G. AU - Jenuwein, T. PY - 2000 DA - 2000// TI - Structure-function analysis of SUV39H1 reveals a dominant role in heterochromatin organization, chromosome segregation, and mitotic progression JO - Mol Cell Biol VL - 20 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.20.10.3728-3741.2000 DO - 10.1128/MCB.20.10.3728-3741.2000 ID - Melcher2000 ER - TY - JOUR AU - Nielsen, P. R. AU - Nietlispach, D. AU - Mott, H. R. AU - Callaghan, J. AU - Bannister, A. AU - Kouzarides, T. AU - Murzin, A. G. AU - Murzina, N. V. AU - Laue, E. D. PY - 2002 DA - 2002// TI - Structure of the HP1 chromodomain bound to histone H3 methylated at lysine 9 JO - Nature VL - 416 UR - https://doi.org/10.1038/nature722 DO - 10.1038/nature722 ID - Nielsen2002 ER - TY - JOUR AU - Fischle, W. AU - Wang, Y. AU - Jacobs, S. A. AU - Kim, Y. AU - Allis, C. D. AU - Khorasanizadeh, S. PY - 2003 DA - 2003// TI - Molecular basis for the discrimination of repressive methyl-lysine marks in histone H3 by Polycomb and HP1 chromodomains JO - Genes Dev VL - 17 UR - https://doi.org/10.1101/gad.1110503 DO - 10.1101/gad.1110503 ID - Fischle2003 ER - TY - JOUR AU - Lachner, M. AU - O'Carroll, D. AU - Rea, S. AU - Mechtler, K. AU - Jenuwein, T. PY - 2001 DA - 2001// TI - Methylation of histone H3 lysine 9 creates a binding site for HP1 proteins JO - Nature VL - 410 UR - https://doi.org/10.1038/35065132 DO - 10.1038/35065132 ID - Lachner2001 ER - TY - JOUR AU - Tamaru, H. AU - Selker, E. U. PY - 2001 DA - 2001// TI - A histone H3 methyltransferase controls DNA methylation in Neurospora crassa JO - Nature VL - 414 UR - https://doi.org/10.1038/35104508 DO - 10.1038/35104508 ID - Tamaru2001 ER - TY - JOUR AU - Tachibana, M. AU - Sugimoto, K. AU - Fukushima, T. AU - Shinkai, J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Set domain-containing protein, G9a, is a novel lysine-preferring mammalian histone methyltransferase with hyperactivity and specific selectivity to lysines 9 and 27 of histone H3 JO - J Biol Chem VL - 276 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M101914200 DO - 10.1074/jbc.M101914200 ID - Tachibana2001 ER - TY - JOUR AU - Schultz, D. C. AU - Ayyanathan, K. AU - Negorev, D. AU - Maul, G. G. AU - Rauscher, F. J. PY - 2002 DA - 2002// TI - SETDB1: a novel KAP-1-associated histone H3, lysine 9-specific methyltransferase that contributes to HP1-mediated silencing of euchromatic genes by KRAB zinc-finger proteins JO - Genes Dev VL - 16 UR - https://doi.org/10.1101/gad.973302 DO - 10.1101/gad.973302 ID - Schultz2002 ER - TY - JOUR AU - Zhang, X. AU - Yang, Z. AU - Khan, S. I. AU - Horton, J. R. AU - Tamaru, H. AU - Selker, E. U. AU - Cheng, X. PY - 2003 DA - 2003// TI - Structural basis for the product specificity of histone lysine methyltransferases JO - Mol Cell VL - 12 UR - https://doi.org/10.1016/S1097-2765(03)00224-7 DO - 10.1016/S1097-2765(03)00224-7 ID - Zhang2003 ER - TY - JOUR AU - Zhang, X. AU - Tamaru, H. AU - Khan, S. I. AU - Horton, J. R. AU - Keefe, L. J. AU - Selker, E. U. AU - Cheng, X. PY - 2002 DA - 2002// TI - Structure of the Neurospora SET domain protein DIM-5, a histone H3 lysine methyltransferase JO - Cell VL - 111 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(02)00999-6 DO - 10.1016/S0092-8674(02)00999-6 ID - Zhang2002 ER - TY - JOUR AU - Rea, S. AU - Eisenhaber, F. AU - O'Carroll, D. AU - Strahl, B. D. AU - Sun, Z. W. AU - Schmid, M. AU - Opravil, S. AU - Mechtler, K. AU - Ponting, C. P. AU - Allis, C. D. AU - Jenuwein, T. PY - 2000 DA - 2000// TI - Regulation of chromatin structure by site-specific histone H3 methyltransferases JO - Nature VL - 406 UR - https://doi.org/10.1038/35020506 DO - 10.1038/35020506 ID - Rea2000 ER - TY - JOUR AU - Collins, R. E. AU - Tachibana, M. AU - Tamaru, H. AU - Smith, K. M. AU - Jia, D. AU - Zhang, X. AU - Selker, E. U. AU - Shinkai, Y. AU - Cheng, X. PY - 2005 DA - 2005// TI - In vitro and in vivo analyses of a Phe/Tyr switch controlling product specificity of histone lysine methyltransferases JO - J Biol Chem VL - 280 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M410483200 DO - 10.1074/jbc.M410483200 ID - Collins2005 ER - TY - JOUR AU - Ner, S. S. AU - Harrington, M. J. AU - Grigliatti, T. A. PY - 2002 DA - 2002// TI - A role for the Drosophila SU(VAR)3-9 protein in chromatin organization at the histone gene cluster and in suppression of position-effect variegation JO - Genetics VL - 162 ID - Ner2002 ER - TY - JOUR AU - Min, J. AU - Zhang, X. AU - Cheng, X. AU - Grewal, S. I. AU - Xu, R. M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Structure of the SET domain histone lysine methyltransferase Clr4 JO - Nat Struct Biol VL - 9 ID - Min2002 ER - TY - JOUR AU - Engel, M. S. AU - Grimaldi, D. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - New light shed on the oldest insect JO - Nature VL - 427 UR - https://doi.org/10.1038/nature02291 DO - 10.1038/nature02291 ID - Engel2004 ER - TY - JOUR AU - Hwang, K. K. AU - Eissenberg, J. C. AU - Worman, H. J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Transcriptional repression of euchromatic genes by Drosophila heterochromatin protein 1 and histone modifiers JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 98 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.211303598 DO - 10.1073/pnas.211303598 ID - Hwang2001 ER - TY - JOUR AU - Donaldson, K. M. AU - Lui, A. AU - Karpen, G. H. PY - 2002 DA - 2002// TI - Modifiers of terminal deficiency-associated position effect variegation in Drosophila JO - Genetics VL - 160 ID - Donaldson2002 ER - TY - JOUR AU - Peters, A. H. AU - O'Carroll, D. AU - Scherthan, H. AU - Mechtler, K. AU - Sauer, S. AU - Schofer, C. AU - Weipoltshammer, K. AU - Pagani, M. AU - Lachner, M. AU - Kohlmaier, A. AU - Opravil, S. AU - Doyle, M. AU - Sibilia, M. AU - Jenuwein, T. PY - 2001 DA - 2001// TI - Loss of the Suv39h histone methyltransferases impairs mammalian heterochromatin and genome stability JO - Cell VL - 107 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(01)00542-6 DO - 10.1016/S0092-8674(01)00542-6 ID - Peters2001 ER - TY - JOUR AU - Criniti, A. AU - Simonazzi, G. AU - Cassanelli, S. AU - Ferrari, M. AU - Bizzaro, D. AU - Manicardi, G. C. PY - 2005 DA - 2005// TI - X-linked heterochromatin distribution in the holocentric chromosomes of the green apple aphid Aphis pomi JO - Genetica VL - 124 UR - https://doi.org/10.1007/s10709-004-8154-y DO - 10.1007/s10709-004-8154-y ID - Criniti2005 ER - TY - JOUR AU - Stoltzfus, A. PY - 1999 DA - 1999// TI - On the possibility of constructive neutral evolution JO - J Mol Evol VL - 49 UR - https://doi.org/10.1007/PL00006540 DO - 10.1007/PL00006540 ID - Stoltzfus1999 ER - TY - JOUR AU - Altschul, S. F. AU - Madden, T. L. AU - Schäffer, A. A. AU - Zhang, J. AU - Zhang, Z. AU - Miller, W. AU - Lipman, D. J. PY - 1997 DA - 1997// TI - Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs JO - Nucleic Acids Res VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/nar/25.17.3389 DO - 10.1093/nar/25.17.3389 ID - Altschul1997 ER - TY - BOOK AU - Ronquist, F. AU - Huelsenbeck, J. P. AU - van der Mark, P. PY - 2005 DA - 2005// TI - MrBayes, a program for the Bayesian inference of phylogeny, version 3.1; ID - Ronquist2005 ER - TY - JOUR AU - Schmidt, H. A. AU - Strimmer, K. AU - Vingron, M. AU - von Haeseler, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - TREE-PUZZLE: maximum likelihood phylogenetic analysis using quartets and parallel computing JO - Bioinformatics VL - 18 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/18.3.502 DO - 10.1093/bioinformatics/18.3.502 ID - Schmidt2002 ER - TY - BOOK AU - Swofford, D. L. PY - 2002 DA - 2002// TI - PAUP*. Phylogenetic analysis using Parsimony (*and other methods), Version 4.0b10. Sunderland: Sinauer ID - Swofford2002 ER - TY - BOOK AU - Felsenstein, J. PY - 2004 DA - 2004// TI - PHYLIP. Phylogeny Inference Package, Version 3.6 ID - Felsenstein2004 ER - TY - JOUR AU - Bruno, W. J. AU - Socci, N. D. AU - Halpern, A. L. PY - 2000 DA - 2000// TI - Weighted neighbor joining: a likelihood-based approach to distance-based phylogeny reconstruction JO - Mol Biol Evol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a026231 DO - 10.1093/oxfordjournals.molbev.a026231 ID - Bruno2000 ER - TY - JOUR AU - Kondrashov, A. S. AU - Sunyaev, S. AU - Kondrashov, F. A. PY - 2002 DA - 2002// TI - Dobzhansky-Muller incompatibilities in protein evolution JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 99 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.232565499 DO - 10.1073/pnas.232565499 ID - Kondrashov2002 ER - TY - JOUR AU - Schwede, T. AU - Kopp, J. AU - Guex, N. AU - Peitsch, M. C. PY - 2003 DA - 2003// TI - SWISS-MODEL: an automated protein homology-modeling server JO - Nucleic Acids Res VL - 31 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkg520 DO - 10.1093/nar/gkg520 ID - Schwede2003 ER - TY - JOUR AU - Horita, D. A. AU - Ivanova, A. V. AU - Altieri, A. S. AU - Klar, A. J. AU - Byrd, R. A. PY - 2001 DA - 2001// TI - Solution structure, domain features, and structural implications of mutants of the chromo domain from the fission yeast histone methyltransferase Clr4 JO - J Mol Biol VL - 307 UR - https://doi.org/10.1006/jmbi.2001.4515 DO - 10.1006/jmbi.2001.4515 ID - Horita2001 ER -