Skip to main content

Table 2 Analysis of the changes in aa of the axolotl p53 protein compared to human p53

From: Urodele p53 tolerates amino acid changes found in p53 variants linked to human cancer

Human codon

# of mutations reported at this site

Axolotl codon

# of mutations identical to the axolotl sequence

temperature sensitive mutations

scorecons

aa changes at this position S/N/X

S 37 : TCC

4

A : GCA

0

 

0.35

+/+/+

M 133 : ATG

49

L : CTC

4

 

1

+/+/+

T 150 : ACA

38

P : CCG

1

 

0.39

-/+/+

T 155 : ACC

128

A : GCA

12

I, N, P

0.02

-/+/+

V 157: GTC

267

L : CTC

10

 

0

-/-/+

M 160 : ATG

45

T : ACT

0

I, K, R, T

0

-/+/+

I 162 : ATC

59

V : GTG

7

 

0

-/+/+

R 174 : AGG

78

K : AAA

12

 

0

+/+/+

S 185 : AGC

23

P : CCC

0

 

0.06

-/+/+

D 186 : GAT

23

N : AAT

5

 

0.01

-/+/+

G 187 : GGT

42

D : GAC

5

 

0.01

-/+/+

L 188 : CTG

14

D : GAT

0

 

0

-/+/+

A 189 : GCC

41

S : TCT

1

P, S

0

-/+/-

P 191 : CCT

55

A : GCC

0

 

0

-/+/-

Q 192 : CAG

112

D : GAT

0

 

0

-/+/+

L 201 : TTG

33

F : TTC

6

 

0.03

-/+/-

L 206 : TTG

20

K : AAG

0

F

0.01

-/+/+

D 207 : GAT

23

M : ATG

0

 

0

-/+/+

D 208 : GAC

49

N : AAT

6

A, V

0

-/-/-

R 209 : AGA

90

S : TCG

1

 

0.01

+/+/+

F 212 : TTT

47

H : CAT

0

V

0

-/+/+

P 222 : CCG

32

T : ACG

1

 

0.02

-/+/+

E 224 : GAG

54

Q : CAG

0

 

0

-/+/+

V 225 : GTT

27

L : CTC

1

 

0.03

-/-/-

D 228 : GAC

51

G : GGA

6

 

0.01

-/-/+

I 232 : ATC

67

V : GTG

6

F, M

0

-/+/+

H 233 : CAC

38

L : CTT

2

 

0

-/+/+

D 259 : GAC

90

T : ACT

0

 

0.01

-/+/+

G 262 : GGT

46

E : GAG

0

 

0

-/-/-

N 263 : AAT

24

Q : CAG

0

 

0.02

-/+/+

N 268 : AAC

25

R : CGC

0

I, T

0.01

-/+/+

S 269 : AGC

46

C : TGC

4

G, I, R

0

-/+/+

R 283 : CGC

126

K : AAG

0

P

0

-/+/-

L 289 : CTC

32

F : TTT

5

P

1

+/+/+

F 338 : TTC

7

Y : TAT

0

S

0.21

-/+/+

E 343 : GAG

7

K : AAG

0

G

0.01

-/+/+

A 353 : GCC

1

M : ATG

0

P

0

+/+/+

S 376 : TCT

2

P : CCT

0

T

0

-/+/+

  1. Bold: aa changes present in axolotl, Spalax (S), Newt (N) and Xenopus (X)
  2. Italic bold: aa changes causing p53 to become temperature sensitive