TY - JOUR AU - Cui, L. AU - Escalante, A. A. AU - Imwong, M. AU - Snounou, G. PY - 2003 DA - 2003// TI - The genetic diversity of Plasmodium vivaxpopulations JO - Trends Parasitol VL - 19 UR - https://doi.org/10.1016/S1471-4922(03)00085-0 DO - 10.1016/S1471-4922(03)00085-0 ID - Cui2003 ER - TY - JOUR AU - Hughes, A. L. AU - Verra, F. PY - 2001 DA - 2001// TI - Very large long-term effective population size in the virulent human malaria parasite Plasmodium falciparum JO - Proc Biol Sci VL - 268 UR - https://doi.org/10.1098/rspb.2001.1759 DO - 10.1098/rspb.2001.1759 ID - Hughes2001 ER - TY - JOUR AU - Hughes, M. K. AU - Hughes, A. L. PY - 1995 DA - 1995// TI - Natural selection on Plasmodiumsurface proteins JO - Mol Biochem Parasitol VL - 71 UR - https://doi.org/10.1016/0166-6851(95)00037-2 DO - 10.1016/0166-6851(95)00037-2 ID - Hughes1995 ER - TY - JOUR AU - Verra, F. AU - Hughes, A. L. PY - 2000 DA - 2000// TI - Evidence for ancient polymorphism at the Apical Membrane Antigen-1 (AMA-1) locus of Plasmodium falciparum JO - Mol Biochem Parasitol VL - 105 UR - https://doi.org/10.1016/S0166-6851(99)00162-0 DO - 10.1016/S0166-6851(99)00162-0 ID - Verra2000 ER - TY - JOUR AU - Takahata, N. AU - Nei, M. PY - 1990 DA - 1990// TI - Allelic genealogy under overdominant and frequency-dependent selection and polymorphism of major histocompatibility complex loci JO - Genetics VL - 124 ID - Takahata1990 ER - TY - JOUR AU - Li, W. -. H. PY - 1978 DA - 1978// TI - Maintenance of genetic variability under the joint effect of mutation, selection, and random drift JO - Genetics VL - 90 ID - Li1978 ER - TY - JOUR AU - Maruyama, T. AU - Nei, M. PY - 1981 DA - 1981// TI - Genetic variability maintained by mutation and overdominant selection in finite populations JO - Genetics VL - 98 ID - Maruyama1981 ER - TY - STD TI - World Healthy Organization (WHO): 2007, [http://www.who.org] UR - http://www.who.org ID - ref8 ER - TY - STD TI - Brazilian Ministry of Health: 2007, [http://portal.saude.gov.br/saude/] UR - http://portal.saude.gov.br/saude/ ID - ref9 ER - TY - JOUR AU - Mendis, K. AU - Sina, B. J. AU - Marchesini, P. AU - Carter, R. PY - 2001 DA - 2001// TI - The neglected burden of Plasmodium vivaxmalaria JO - Am J Trop Med Hyg VL - 64 ID - Mendis2001 ER - TY - JOUR AU - Jongwutiwes, S. AU - Putaporntip, C. AU - Iwasaki, T. AU - Ferreira, M. U. AU - Kanbara, H. AU - Hughes, A. L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Mitochondrial genome sequences support ancient population expansion in Plasmodium vivax JO - Mol Biol Evol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msi168 DO - 10.1093/molbev/msi168 ID - Jongwutiwes2005 ER - TY - JOUR AU - De Castro, M. C. AU - Singer, B. H. PY - 2005 DA - 2005// TI - Was malaria present in the Amazon before the European conquest? Avaiable evidence and future research agenda JO - J Achaeol Sci VL - 32 UR - https://doi.org/10.1016/j.jas.2004.10.004 DO - 10.1016/j.jas.2004.10.004 ID - De Castro2005 ER - TY - JOUR AU - Anderson, T. J. AU - Haubold, B. AU - Williams, J. T. AU - Estrada-Franco, J. G. AU - Richardson, L. AU - Mollinedo, R. AU - Bockarie, M. AU - Mokili, J. AU - Mharakurwa, S. AU - French, N. AU - Whitworth, J. AU - Velez, I. D. AU - Brockman, A. H. AU - Nosten, F. AU - Ferreira, M. U. AU - Day, K. P. PY - 2000 DA - 2000// TI - Microsatellite markers reveal a spectrum of population structures in the malaria parasite Plasmodium falciparum JO - Mol Biol Evol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a026247 DO - 10.1093/oxfordjournals.molbev.a026247 ID - Anderson2000 ER - TY - JOUR AU - Karunaweera, N. D. AU - Ferreira, M. U. AU - Munasinghe, A. AU - Barnwell, J. W. AU - Collins, W. E. AU - King, C. L. AU - Kawamoto, F. AU - Hartl, D. L. AU - Wirth, D. F. PY - 2008 DA - 2008// TI - Extensive microsatellite diversity in the human malaria parasite Plasmodium vivax JO - Gene VL - 410 UR - https://doi.org/10.1016/j.gene.2007.11.022 DO - 10.1016/j.gene.2007.11.022 ID - Karunaweera2008 ER - TY - JOUR AU - Gomez, J. C. AU - McNamara, D. T. AU - Bockarie, M. J. AU - Baird, J. K. AU - Carlton, J. M. AU - Zimmerman, P. A. PY - 2003 DA - 2003// TI - Identification of a polymorphic Plasmodium vivaxmicrosatellite marker JO - Am J Trop Med Hyg VL - 69 ID - Gomez2003 ER - TY - JOUR AU - Leclerc, M. C. AU - Durand, P. AU - Gauthier, C. AU - Patot, S. AU - Billotte, N. AU - Menegon, M. AU - Severini, C. AU - Ayala, F. J. AU - Renaud, F. PY - 2004 DA - 2004// TI - Meager genetic variability of the human malaria agent Plasmodium vivax JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 101 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0405186101 DO - 10.1073/pnas.0405186101 ID - Leclerc2004 ER - TY - JOUR AU - Imwong, M. AU - Sudimack, D. AU - Pukrittayakamee, S. AU - Osorio, L. AU - Carlton, J. M. AU - Day, N. P. AU - White, N. J. AU - Anderson, T. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Microsatellite variation, repeat array length, and population history of Plasmodium vivax JO - Mol Biol Evol VL - 23 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msj116 DO - 10.1093/molbev/msj116 ID - Imwong2006 ER - TY - JOUR AU - Ferreira, M. U. AU - Karunaweera, N. D. AU - da Silva-Nunes, M. AU - da Silva, N. S. AU - Wirth, D. F. AU - Hartl, D. L. PY - 2007 DA - 2007// TI - Population structure and transmission dynamics of Plasmodium vivax in rural Amazonia JO - J Infect Dis VL - 15:195 UR - https://doi.org/10.1086/512685 DO - 10.1086/512685 ID - Ferreira2007 ER - TY - JOUR AU - Cheng, Q. AU - Stowers, A. AU - Huang, T. Y. AU - Bustos, D. AU - Huang, Y. M. AU - Rzepczyk, C. AU - Saul, A. PY - 1993 DA - 1993// TI - Polymorphism in Plasmodium vivaxMSA-1 gene – the result of intragenic recombinations? JO - Parasitol VL - 106 UR - https://doi.org/10.1017/S003118200006707X DO - 10.1017/S003118200006707X ID - Cheng1993 ER - TY - JOUR AU - Figtree, M. AU - Pasay, C. J. AU - Slade, R. AU - Cheng, Q. AU - Cloonan, N. AU - Walker, J. AU - Saul, A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Plasmodium vivaxsynonymous substitution frequencies, evolution and population structure deduced from diversity in AMA-1 and MSP-1 genes JO - Mol Bio Parasitol VL - 108 UR - https://doi.org/10.1016/S0166-6851(00)00204-8 DO - 10.1016/S0166-6851(00)00204-8 ID - Figtree2000 ER - TY - JOUR AU - Lim, C. S. AU - Kim, S. H. AU - Kwon, S. I. AU - Song, J. W. AU - Song, K. J. AU - Lee, K. N. PY - 2000 DA - 2000// TI - Analysis of Plasmodium vivaxmerozoite surface protein-1 gene sequences from resurgent Korean isolates JO - Am J Trop Med Hyg VL - 62 ID - Lim2000 ER - TY - JOUR AU - Gutierrez, A. AU - Vicini, J. AU - Patarroyo, M. E. AU - Murillo, L. A. AU - Patarroyo, M. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Plasmodium vivax: polymorphism in the merozoite surface protein 1 gene from wild Colombian isolates JO - Exp Parasitol VL - 95 UR - https://doi.org/10.1006/expr.2000.4534 DO - 10.1006/expr.2000.4534 ID - Gutierrez2000 ER - TY - JOUR AU - Zakeri, S. AU - Dinparast Djadid, N. AU - Zeinali, S. PY - 2003 DA - 2003// TI - Sequence heterogeneity of the merozoite surface protein-1 gene (MSP-1) of Plasmodium vivaxwild isolates in southeastern Iran JO - Acta Trop VL - 88 UR - https://doi.org/10.1016/S0001-706X(03)00192-X DO - 10.1016/S0001-706X(03)00192-X ID - Zakeri2003 ER - TY - JOUR AU - Leclerc, M. C. AU - Menegon, M. AU - Cligny, A. AU - Noyer, J. L. AU - Mammadov, S. AU - Aliyev, N. AU - Gasimov, E. AU - Majori, G. AU - Severini, C. PY - 2004 DA - 2004// TI - Genetic diversity of Plasmodium vivaxisolates from Azerbaijan JO - Mal J VL - 3 UR - https://doi.org/10.1186/1475-2875-3-40 DO - 10.1186/1475-2875-3-40 ID - Leclerc2004 ER - TY - JOUR AU - Leclerc, M. C. AU - Gauthier, C. AU - Villegas, L. AU - Urdaneta, L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Genetic diversity of merozoite surface protein-1 gene of Plasmodium vivaxisolates in mining villages of Venezuela (Bolivar State) JO - Acta Trop VL - 95 UR - https://doi.org/10.1016/j.actatropica.2005.03.007 DO - 10.1016/j.actatropica.2005.03.007 ID - Leclerc2005 ER - TY - JOUR AU - Zakeri, S. AU - Mehrizi, A. A. AU - Mamaghani, S. AU - Noorizadeh, S. AU - Snounou, G. AU - Djadid, N. D. PY - 2006 DA - 2006// TI - Population structure analysis of Plasmodium vivaxin areas of iran with different malaria endemicity JO - Am J Trop Med Hyg VL - 74 ID - Zakeri2006 ER - TY - JOUR AU - Kim, J. R. AU - Imwong, M. AU - Nandy, A. AU - Chotivanich, K. AU - Nontprasert, A. AU - Tonomsing, N. AU - Maji, A. AU - Addy, M. AU - Day, N. P. AU - White, N. J. AU - Pukrittayakamee, S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genetic diversity of Plasmodium vivaxin Kolkata, India JO - Mal J VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/1475-2875-5-71 DO - 10.1186/1475-2875-5-71 ID - Kim2006 ER - TY - JOUR AU - Bonilla, J. A. AU - Validum, L. AU - Cummings, R. AU - Palmer, C. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Genetic diversity of Plasmodium vivaxPvcsp and Pvmsp1 in Guyana, South America JO - Am J Trop Med Hyg VL - 75 ID - Bonilla2006 ER - TY - JOUR AU - Kain, K. C. AU - Brown, A. E. AU - Webster, H. K. AU - Wirtz, R. A. AU - Keystone, J. S. AU - Rodriguez, M. H. AU - Kinahan, J. AU - Rowland, M. AU - Lanar, D. E. PY - 1992 DA - 1992// TI - Circumsporozoite genotyping of global isolates of Plasmodium vivaxfrom dried blood specimens JO - J Clin Microbiol VL - 30 ID - Kain1992 ER - TY - JOUR AU - Santos-Ciminera, P. D. AU - Alecrim, M. G. AU - Roberts, D. R. AU - Quinnan, G. V. PY - 2007 DA - 2007// TI - Molecular epidemiology of Plasmodium vivaxin the State of Amazonas, Brazil JO - Acta Trop VL - 102 UR - https://doi.org/10.1016/j.actatropica.2007.02.013 DO - 10.1016/j.actatropica.2007.02.013 ID - Santos-Ciminera2007 ER - TY - JOUR AU - Cheng, Q. AU - Saul, A. PY - 1994 DA - 1994// TI - Sequence analysis of the apical membrane antigen I (AMA-1) of Plasmodium vivax JO - Mol Biochem Parasitol VL - 65 UR - https://doi.org/10.1016/0166-6851(94)90127-9 DO - 10.1016/0166-6851(94)90127-9 ID - Cheng1994 ER - TY - JOUR AU - Han, E. T. AU - Park, J. H. AU - Shin, E. H. AU - Choi, M. H. AU - Oh, M. D. AU - Chai, J. Y. PY - 2002 DA - 2002// TI - Apical membrane antigen-1 (AMA-1) gene sequences of re-emerging Plasmodium vivaxin South Korea JO - Kor J Parasitol VL - 40 UR - https://doi.org/10.3347/kjp.2002.40.3.157 DO - 10.3347/kjp.2002.40.3.157 ID - Han2002 ER - TY - JOUR AU - Chung, J. Y. AU - Chun, E. H. AU - Chun, J. H. AU - Kho, W. G. PY - 2003 DA - 2003// TI - Analysis of the Plasmodium vivaxapical membrane antigen 1 gene from re-emerging Korean isolates JO - Parasitol Res VL - 90 UR - https://doi.org/10.1007/s00436-002-0777-2 DO - 10.1007/s00436-002-0777-2 ID - Chung2003 ER - TY - JOUR AU - Rodrigues, M. H. AU - Rodrigues, K. M. AU - Oliveira, T. R. AU - Comodo, A. N. AU - Rodrigues, M. M. AU - Kocken, C. H. AU - Thomas, A. W. AU - Soares, I. S. PY - 2005 DA - 2005// TI - Antibody response of naturally infected individuals to recombinant Plasmodium vivaxapical membrane antigen-1 JO - Int J Parasitol VL - 35 UR - https://doi.org/10.1016/j.ijpara.2004.11.003 DO - 10.1016/j.ijpara.2004.11.003 ID - Rodrigues2005 ER - TY - JOUR AU - Gunasekera, A. M. AU - Wickramarachchi, T. AU - Neafsey, D. E. AU - Ganguli, I. AU - Perera, L. AU - Premaratne, P. H. AU - Hartl, D. AU - Handunnetti, S. M. AU - Udagama-Randeniya, P. V. AU - Wirth, D. F. PY - 2007 DA - 2007// TI - Genetic Diversity and Selection at the Plasmodium vivaxApical Membrane Antigen-1 (PvAMA-1) locus in a Sri Lankan population JO - Mol Biol Evol VL - 24 UR - https://doi.org/10.1093/molbev/msm013 DO - 10.1093/molbev/msm013 ID - Gunasekera2007 ER - TY - JOUR AU - Rajesh, V. AU - Elamaran, M. AU - Vidya, S. AU - Gowrishankar, M. AU - Kochar, D. AU - Das, A. PY - 2007 DA - 2007// TI - Plasmodium vivax: Genetic diversity of the apical membrane antigen-1 (AMA-1) in isolates from India JO - Exp Parasitol VL - 116 UR - https://doi.org/10.1016/j.exppara.2007.01.006 DO - 10.1016/j.exppara.2007.01.006 ID - Rajesh2007 ER - TY - JOUR AU - Peterson, M. G. AU - Marshall, V. M. AU - Smythe, J. A. AU - Crewther, P. E. AU - Lew, A. AU - Silva, A. AU - Andres, R. F. AU - Kemp, D. J. PY - 1989 DA - 1989// TI - Integral membrane protein located in the apical complex of Plasmodium falciparum JO - Mol Cell Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.9.7.3151 DO - 10.1128/MCB.9.7.3151 ID - Peterson1989 ER - TY - JOUR AU - Narum, D. L. AU - Thomas, A. W. PY - 1994 DA - 1994// TI - Differential localization of full-length and processed forms of PF83/AMA-1: an apical membrane antigen of Plasmodium falciparummerozoites JO - Mol Biochem Parasitol VL - 67 UR - https://doi.org/10.1016/0166-6851(94)90096-5 DO - 10.1016/0166-6851(94)90096-5 ID - Narum1994 ER - TY - JOUR AU - Galinski, M. R. AU - Barnwell, J. W. PY - 1996 DA - 1996// TI - Plasmodium vivax: merozoítos, invasion of reticulocytes and considerations for malaria vaccine development JO - Parasitol Today VL - 12 UR - https://doi.org/10.1016/0169-4758(96)80641-7 DO - 10.1016/0169-4758(96)80641-7 ID - Galinski1996 ER - TY - JOUR AU - Riley, E. M. AU - Wagner, G. E. AU - Ofori, M. F. AU - Wheeler, J. G. AU - Akanmori, B. D. AU - Tetteh, K. AU - McGuinness, D. AU - Bennett, S. AU - Nkrumah, F. K. AU - Anders, R. F. AU - Koram, K. A. PY - 2000 DA - 2000// TI - Lack of association between maternal antibody and protection of African infants from malaria infection JO - Infect Immun VL - 68 UR - https://doi.org/10.1128/IAI.68.10.5856-5863.2000 DO - 10.1128/IAI.68.10.5856-5863.2000 ID - Riley2000 ER - TY - JOUR AU - Hodder, A. N. AU - Crewther, P. E. AU - Mattew, M. L. S. M. AU - Reid, G. E. AU - Moritz, R. L. AU - Simpson, R. J. AU - Anders, R. F. PY - 1996 DA - 1996// TI - The disulphide bond structure of Plasmodiumapical membrane antigen-1 JO - J Biol Chem VL - 271 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.271.46.29446 DO - 10.1074/jbc.271.46.29446 ID - Hodder1996 ER - TY - JOUR AU - Crewther, P. E. AU - Culvenor, J. G. AU - Silva, A. AU - Cooper, J. A. AU - Anders, R. F. PY - 1990 DA - 1990// TI - Plasmodium falciparum: two antigens of similar size are located in different compartiments of the rhoptry JO - Exp Parasitol VL - 70 UR - https://doi.org/10.1016/0014-4894(90)90100-Q DO - 10.1016/0014-4894(90)90100-Q ID - Crewther1990 ER - TY - JOUR AU - Mitchell, G. H. AU - Thomas, A. W. AU - Margos, G. AU - Dluzewski, A. R. AU - Bannister, L. H. PY - 2004 DA - 2004// TI - Apical Membrane Antigen 1, a Major Malaria Vaccine Candidate, Mediates the Close Attachment of Invasive Merozoites to Host Blood Cells JO - Infect Immun VL - 72 UR - https://doi.org/10.1128/IAI.72.1.154-158.2004 DO - 10.1128/IAI.72.1.154-158.2004 ID - Mitchell2004 ER - TY - JOUR AU - Hodder, A. N. AU - Crewther, P. E. AU - Anders, R. F. PY - 2001 DA - 2001// TI - Specificity of the protective antibody response to apical membrane antigen 1 JO - Infect Immun VL - 69 UR - https://doi.org/10.1128/IAI.69.5.3286-3294.2001 DO - 10.1128/IAI.69.5.3286-3294.2001 ID - Hodder2001 ER - TY - JOUR AU - Healer, J. AU - Murphy, V. AU - Hodder, A. N. AU - Masciantonio, R. AU - Gemmil, A. W. AU - Anders, R. F. AU - Cowman, A. F. AU - Batchelor, A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Allelic polymorphism in apical membrane antigen-1 are responsible for evasion of antibody-mediated inhibition in Plasmodium falciparum JO - Mol Microbiol VL - 52 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2958.2003.03974.x DO - 10.1111/j.1365-2958.2003.03974.x ID - Healer2004 ER - TY - JOUR AU - Castro, M. C. AU - Monte-Mór, R. L. AU - Sawyer, D. O. AU - Singer, B. H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Malaria risk on the Amazon frontier JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0510576103 DO - 10.1073/pnas.0510576103 ID - Castro2006 ER - TY - JOUR AU - Castro, M. C. AU - Sawyer, D. O. AU - Singer, B. H. PY - 2007 DA - 2007// TI - Spatial patterns of malaria in the Amazon: implications for surveillance and targeted interventions JO - Health and Place VL - 13 UR - https://doi.org/10.1016/j.healthplace.2006.03.006 DO - 10.1016/j.healthplace.2006.03.006 ID - Castro2007 ER - TY - JOUR AU - Gil, L. H. AU - Tada, M. S. AU - Katsuragawa, T. H. AU - Ribolla, P. E. AU - Pereira da Silva, L. H. PY - 2007 DA - 2007// TI - Urban and suburban malaria in Rondônia (Brazilian Western Amazon) II. Perennial transmissions with high anopheline densities are associated with human environmental changes JO - Mem Inst Oswaldo Cruz VL - 102 UR - https://doi.org/10.1590/S0074-02762007005000013 DO - 10.1590/S0074-02762007005000013 ID - Gil2007 ER - TY - JOUR AU - Tada, M. S. AU - Marques, R. P. AU - Mesquita, E. AU - Dalla Martha, R. C. AU - Rodrigues, J. A. AU - Costa, J. D. AU - Pepelascov, R. P. AU - Katsuragawa, T. H. AU - Pereira-da-Silva, L. H. PY - 2007 DA - 2007// TI - Urban malaria in the Brazilian Western Amazon Region I. High prevalence of asymptotic carriers in an urban riverside district is associated with a high level of clinical malaria JO - Mem Inst Oswaldo Cruz VL - 102 UR - https://doi.org/10.1590/S0074-02762007005000012 DO - 10.1590/S0074-02762007005000012 ID - Tada2007 ER - TY - JOUR AU - Cao, K. AU - Moormann, A. M. AU - Lyke, K. E. AU - Masaberg, C. AU - Sumba, O. P. AU - Doumbo, O. K. AU - Koech, D. AU - Lancaster, A. AU - Nelson, M. AU - Meyer, D. AU - Single, R. AU - Hartzman, R. J. AU - Plowe, C. V. AU - Kazura, J. AU - Mann, D. L. AU - Sztein, M. B. AU - Thomson, G. AU - Fernández-Viña PY - 2004 DA - 2004// TI - Differentiation between African populations is evidenced by the diversity of alleles and haplotypes of HLA class I loci JO - Tissue Antigens VL - 63 UR - https://doi.org/10.1111/j.0001-2815.2004.00192.x DO - 10.1111/j.0001-2815.2004.00192.x ID - Cao2004 ER - TY - JOUR AU - Hughes, A. L. AU - Nei, M. PY - 1988 DA - 1988// TI - Pattern of nucleotide substitution at MHC class I loci reveals overdominant selection JO - Nature VL - 335 UR - https://doi.org/10.1038/335167a0 DO - 10.1038/335167a0 ID - Hughes1988 ER - TY - JOUR AU - Hughes, A. L. AU - Hughes, M. K. PY - 1995 DA - 1995// TI - Natural selection on the peptide-binding regions of major histocompatibility complex molecules JO - Immunogenetics VL - 42 UR - https://doi.org/10.1007/BF00176440 DO - 10.1007/BF00176440 ID - Hughes1995 ER - TY - JOUR AU - Hughes, A. L. AU - Verra, F. PY - 2002 DA - 2002// TI - Extensive polymorphism and ancient origin of Plasmodium falciparum JO - Trends Parasitol VL - 18 UR - https://doi.org/10.1016/S1471-4922(02)02290-0 DO - 10.1016/S1471-4922(02)02290-0 ID - Hughes2002 ER - TY - JOUR AU - Thompson, J. D. AU - Higgings, D. G. AU - Gibson, T. J. PY - 1994 DA - 1994// TI - CLUSTALW: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment thought sequence weighting, position specific gap penalties and weight matrix choice JO - Nucleics Acids Res VL - 22 UR - https://doi.org/10.1093/nar/22.22.4673 DO - 10.1093/nar/22.22.4673 ID - Thompson1994 ER - TY - JOUR AU - Kumar, S. AU - Tamura, K. AU - Nei, M. PY - 2004 DA - 2004// TI - MEGA3.1. Integrated software for Molecular Evolutionary Genetics Analysis and sequence alignment JO - Brief Bioinform VL - 5 UR - https://doi.org/10.1093/bib/5.2.150 DO - 10.1093/bib/5.2.150 ID - Kumar2004 ER - TY - JOUR AU - Saitou, N. AU - Nei, M. PY - 1987 DA - 1987// TI - The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees JO - Mol Biol Evol VL - 4 ID - Saitou1987 ER - TY - CHAP AU - Jukes, T. H. AU - Cantor, C. R. ED - Munro, H. N. PY - 1969 DA - 1969// TI - Evolution of protein molecules BT - Mammalian Protein Metabolism PB - Academic Press CY - New York UR - https://doi.org/10.1016/B978-1-4832-3211-9.50009-7 DO - 10.1016/B978-1-4832-3211-9.50009-7 ID - Jukes1969 ER - TY - JOUR AU - Felsenstein, J. PY - 1985 DA - 1985// TI - Confidence limits on phylogenies: An approach using the bootstrap JO - Evolution VL - 39 UR - https://doi.org/10.2307/2408678 DO - 10.2307/2408678 ID - Felsenstein1985 ER - TY - STD TI - Maynard Smith J: Analyzing the mosaic structure of genes. J Mol Evol. 34: 126-129. ID - ref59 ER - TY - JOUR AU - Martin, D. R. AU - Williamson, C. AU - Posada, D. PY - 2005 DA - 2005// TI - RDP2: recombination detection and analysis from sequence alignments JO - Bioinformatics VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bth490 DO - 10.1093/bioinformatics/bth490 ID - Martin2005 ER - TY - JOUR AU - Nei, M. AU - Gojobori, T. PY - 1986 DA - 1986// TI - Simple methods for estimating the numbers of synonymous and nonsynonymous nucleotide substitutions JO - Mol Biol Evol VL - 3 ID - Nei1986 ER -