Skip to main content

Table 1 Genotype frequencies of the 11 polymorphisms located at the HSP90AA1 gene in the 31 sheep breeds studied

From: Looking for adaptive footprints in the HSP90AA1 ovine gene

 

g.703_704del(2)A

g.667_668insC

g.666_667insC

g.660G > C

g.601A > C

g.528G > A

g.524G > T

g.522A > G

g.516_517insG

g.468G > T

g.444A > G

Breed

ID breed

DD

AD

AA

II

ID

DD

II

ID

DD

GG

CG

CC

AA

AC

CC

GG

AG

AA

GG

GT

TT

AA

AG

GG

II

ID

DD

GG

GT

TT

AA

AG

GG

Akkaraman

AKA

0.13

0.52

0.35

0.00

0.48

0.52

0.04

0.22

0.74

0.13

0.52

0.35

0.04

0.39

0.57

0.04

0.57

0.39

0.00

0.39

0.61

0.00

0.09

0.91

0.00

0.04

0.96

0.00

0.39

0.61

0.00

0.26

0.74

Kazakh Arkhar-Merino

ARME

0.11

0.50

0.39

0.00

0.50

0.50

0.17

0.00

0.83

0.06

0.50

0.44

0.00

0.17

0.83

0.06

0.44

0.50

0.00

0.17

0.83

0.00

0.00

1.00

0.00

0.39

0.61

0.00

0.17

0.83

0.00

0.28

0.72

Assaf

AS

0.00

0.20

0.80

0.13

0.53

0.33

0.10

0.10

0.80

0.00

0.20

0.80

0.00

0.57

0.43

0.00

0.20

0.80

0.00

0.57

0.43

0.00

0.00

1.00

0.00

0.00

1.00

0.00

0.57

0.43

0.03

0.17

0.80

Awassi

AW

0.00

0.30

0.70

0.03

0.49

0.49

0.00

0.00

1.00

0.00

0.27

0.73

0.13

0.57

0.30

0.00

0.27

0.73

0.13

0.57

0.30

0.00

0.00

1.00

0.00

0.00

1.00

0.13

0.57

0.30

0.00

0.03

0.97

Bajdarak

BAJ

0.27

0.50

0.23

0.00

0.14

0.86

0.00

0.00

1.00

0.14

0.64

0.23

0.00

0.36

0.64

0.05

0.59

0.36

0.00

0.36

0.64

0.00

0.14

0.86

0.00

0.05

0.95

0.00

0.32

0.68

0.00

0.18

0.82

Bni Guil

BNI

0.15

0.56

0.30

0.00

0.37

0.63

0.04

0.22

0.74

0.15

0.56

0.30

0.00

0.22

0.78

0.11

0.48

0.41

0.00

0.15

0.85

0.00

0.11

0.89

0.00

0.15

0.85

0.04

0.19

0.78

0.04

0.26

0.70

Boujaad

BOUJ

0.17

0.25

0.58

0.00

0.46

0.54

0.00

0.13

0.88

0.17

0.25

0.58

0.00

0.25

0.75

0.00

0.33

0.58

0.00

0.00

0.01

0.00

0.13

0.88

0.00

0.21

0.79

0.00

0.25

0.75

0.00

0.17

0.83

Bozakh

BOZ

0.33

0.29

0.38

0.04

0.38

0.58

0.08

0.13

0.79

0.33

0.29

0.38

0.00

0.21

0.79

0.17

0.46

0.38

0.00

0.21

0.79

0.00

0.00

1.00

0.00

0.08

0.92

0.00

0.21

0.79

0.04

0.17

0.79

Caucasian

CAUC

0.20

0.32

0.48

0.04

0.32

0.64

0.12

0.00

0.88

0.12

0.40

0.48

0.00

0.20

0.80

0.08

0.44

0.48

0.00

0.12

0.88

0.00

0.00

1.00

0.12

0.32

0.56

0.00

0.20

0.80

0.04

0.16

0.80

Churra

Ch

0.00

0.52

0.48

0.09

0.30

0.61

0.04

0.26

0.70

0.00

0.52

0.48

0.00

0.26

0.74

0.00

0.52

0.48

0.00

0.26

0.74

0.00

0.22

0.78

0.00

0.30

0.70

0.00

0.26

0.74

0.04

0.35

0.61

Churra Lebrijana

Cl

0.00

0.42

0.58

0.38

0.42

0.19

0.00

0.00

1.00

0.00

0.38

0.62

0.00

0.12

0.88

0.00

0.38

0.62

0.00

0.15

0.85

0.00

0.00

1.00

0.00

0.04

0.96

0.00

0.15

0.85

0.00

0.04

0.96

Churra Tensina

Ct

0.24

0.36

0.39

0.00

0.18

0.82

0.00

0.00

1.00

0.15

0.42

0.42

0.03

0.00

0.97

0.15

0.42

0.42

0.00

0.03

0.97

0.00

0.00

1.00

0.09

0.45

0.45

0.00

0.03

0.97

0.00

0.03

0.97

Daglic

DGL

0.42

0.42

0.17

0.00

0.08

0.92

0.00

0.00

1.00

0.42

0.42

0.17

0.13

0.13

0.75

0.42

0.42

0.17

0.13

0.13

0.75

0.00

0.00

1.00

0.00

0.04

0.96

0.13

0.13

0.75

0.00

0.00

1.00

Kazakh Edilbai

EDIL

0.00

0.10

0.90

0.00

0.03

0.97

0.00

0.00

1.00

0.33

0.67

0.00

0.00

0.03

0.97

0.27

0.70

0.03

0.00

0.03

0.97

0.00

0.03

0.97

0.00

0.10

0.90

0.00

0.00

0.01

0.00

0.00

1.00

Ivesi

IV

0.20

0.27

0.53

0.07

0.13

0.80

0.07

0.07

0.87

0.20

0.27

0.53

0.13

0.33

0.53

0.20

0.20

0.60

0.13

0.33

0.53

0.00

0.07

0.93

0.00

0.00

1.00

0.13

0.33

0.53

0.07

0.07

0.87

Russian Karakul

KAR

0.27

0.73

0.00

0.00

0.00

1.00

0.00

0.00

1.00

0.20

0.80

0.00

0.00

0.60

0.40

0.27

0.73

0.00

0.00

0.60

0.40

0.00

0.00

1.00

0.00

0.00

1.00

0.07

0.53

0.40

0.00

0.00

1.00

Moldavian Karakul

KARM

0.73

0.27

0.00

0.07

0.00

0.93

0.00

0.00

1.00

0.27

0.73

0.00

0.00

0.40

0.60

0.27

0.67

0.07

0.00

0.40

0.60

0.00

0.00

1.00

0.00

0.07

0.93

0.00

0.40

0.60

0.00

0.07

0.93

Karabakh

KRB

0.25

0.67

0.08

0.00

0.42

0.58

0.00

0.08

0.92

0.25

0.67

0.08

0.00

0.17

0.83

0.13

0.71

0.17

0.00

0.17

0.83

0.00

0.08

0.92

0.00

0.00

1.00

0.00

0.25

0.75

0.00

0.25

0.75

Karachai

KRC

0.36

0.54

0.11

0.00

0.25

0.75

0.04

0.07

0.89

0.25

0.61

0.14

0.00

0.29

0.71

0.25

0.61

0.14

0.00

0.29

0.71

0.00

0.04

0.96

0.00

0.04

0.96

0.00

0.29

0.71

0.00

0.18

0.82

Karayaka

KRY

0.09

0.36

0.55

0.00

0.18

0.82

0.05

0.05

0.91

0.09

0.36

0.55

0.09

0.32

0.59

0.09

0.27

0.64

0.05

0.36

0.59

0.00

0.05

0.95

0.00

0.27

0.73

0.09

0.36

0.55

0.00

0.14

0.86

Kivircik

KVR

0.00

0.50

0.50

0.13

0.63

0.25

0.00

0.13

0.88

0.00

0.50

0.50

0.00

0.19

0.81

0.06

0.31

0.63

0.00

0.13

0.88

0.00

0.00

1.00

0.00

0.06

0.94

0.00

0.19

0.81

0.00

0.19

0.81

Finnsheep

L

0.17

0.50

0.33

0.10

0.37

0.53

0.10

0.37

0.53

0.17

0.50

0.33

0.03

0.03

0.93

0.10

0.47

0.43

0.03

0.03

0.93

0.00

0.00

1.00

0.00

0.03

0.97

0.03

0.03

0.93

0.10

0.37

0.53

Latxa

LX

0.02

0.46

0.51

0.00

0.49

0.51

0.00

0.37

0.63

0.00

0.22

0.78

0.00

0.29

0.71

0.00

0.20

0.80

0.00

0.29

0.71

0.00

0.00

1.00

0.02

0.37

0.61

0.00

0.29

0.71

0.00

0.46

0.54

D’Man

MAN

0.08

0.46

0.46

0.00

0.08

0.92

0.00

0.08

0.92

0.04

0.50

0.46

0.08

0.38

0.54

0.00

0.04

0.96

0.08

0.31

0.62

0.00

0.00

1.00

0.08

0.27

0.65

0.08

0.38

0.54

0.12

0.38

0.50

Spanish Merino

ME

0.17

0.31

0.52

0.07

0.48

0.45

0.03

0.10

0.86

0.07

0.41

0.52

0.00

0.14

0.86

0.03

0.21

0.76

0.00

0.14

0.86

0.00

0.10

0.90

0.00

0.17

0.83

0.00

0.14

0.86

0.03

0.41

0.55

Manchega

MNCH

0.05

0.53

0.42

0.02

0.42

0.57

0.00

0.07

0.93

0.05

0.53

0.42

0.00

0.33

0.67

0.03

0.53

0.43

0.00

0.32

0.68

0.00

0.03

0.97

0.02

0.33

0.65

0.00

0.32

0.68

0.00

0.10

0.90

Olkuska

OL

0.10

0.47

0.43

0.03

0.50

0.47

0.07

0.37

0.57

0.10

0.47

0.43

0.00

0.00

1.00

0.10

0.47

0.43

0.00

0.00

1.00

0.00

0.00

1.00

0.00

0.17

0.83

0.00

0.00

1.00

0.07

0.43

0.50

Pramenka

PRAM

0.21

0.24

0.55

0.14

0.41

0.45

0.10

0.34

0.55

0.21

0.24

0.55

0.00

0.31

0.69

0.21

0.21

0.59

0.00

0.31

0.69

0.00

0.00

1.00

0.00

0.10

0.90

0.00

0.31

0.69

0.03

0.48

0.48

Rasa Aragonesa

RA

0.05

0.33

0.62

0.07

0.40

0.52

0.07

0.07

0.86

0.05

0.31

0.64

0.02

0.17

0.81

0.05

0.24

0.71

0.02

0.17

0.81

0.00

0.10

0.90

0.05

0.31

0.64

0.02

0.17

0.81

0.05

0.19

0.76

Sakiz

SZ

0.04

0.38

0.58

0.19

0.38

0.42

0.00

0.00

1.00

0.04

0.38

0.58

0.00

0.12

0.88

0.00

0.31

0.69

0.00

0.12

0.88

0.00

0.00

1.00

0.00

0.00

1.00

0.00

0.08

0.92

0.00

0.00

1.00

Valle del Belice

VdB

0.14

0.55

0.31

0.03

0.31

0.66

0.10

0.03

0.86

0.10

0.55

0.34

0.00

0.00

1.00

0.07

0.45

0.48

0.00

0.03

0.97

0.00

0.00

1.00

0.03

0.31

0.66

0.00

0.03

0.97

0.03

0.21

0.76