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Table 6 Salient features of putative GH9 endoglucanase sequences with multiple delineable domains

From: Origin, evolution, and divergence of plant class C GH9 endoglucanases

  

GH9

CBM2

CBM3

CBM4_9

CBM10

CBMX_2

CBM49

pattern 20

ALS (n = 3)

gi|313241202

Y

  

Y (cT)

   

Y

gi|260808721

Y

Y (nT)

     

Y

gi|254553092

Y

Y (nT)

     

Y

BAC (n = 24)

gi|15894203

Y

 

Y (cT)

    

Y

gi|15894200

Y

 

Y (cT)

    

Y

gi|15893851

Y

  

Y (nT)

   

Y

gi|300789210

Y

Y (cT)

 

Y (nT)

   

Y

gi|300785821

Y

 

YY (cT)

    

Y

gi|121833

Y

 

YY (cT)

  

YY (cT)

 

Y

gi|320006799

Y

Y (cT)

 

Y (nT)

   

Y

gi|295094191

Y

  

Y (nT)

   

Y

gi|291544575

Y

  

Y (nT)

   

Y

gi|291543938

Y

 

Y (cT)

    

Y

gi|34811382

Y

 

Y (cT)

    

Y

gi|34811081

Y

 

Y (cT)

    

Y

gi|2554767

Y

 

Y (cT)

    

Y

gi|551774

Y

 

Y (cT)

    

Y

gi|311900744

Y

Y (cT)

     

Y

gi|311900370

Y

Y (cT)

Y (cT)

    

Y

gi|270288703

Y

 

Y (cT)

    

Y

gi|270288702

Y

 

Y (cT)

    

Y

gi|270288700

Y

  

Y (nT)

   

Y

gi|270288699

Y

 

Y (cT)

    

Y

gi|39636954

Y

 

Y (cT)

    

Y

gi|6272570

Y

  

Y (nT)

   

YYYYY

gi|237858935

Y

Y (cT)

  

Y (cT)

  

YY

gi|4490766

Y

 

YY (cT)

    

YYY

PRS (n = 2)

gi|281207043

Y

     

Y (cT)

 

gi|281207029

Y

     

Y (cT)

 
  1. Abbreviations: ALS Animals, BAC Bacteria, PRS Protists, Y Present, nT N-terminal, cT C-terminal, GH9 Glycoside hydrolase 9, CBM Carbohydrate binding module