Skip to main content

Table 2 Location of features in the mitogenome of two species of Asymmetron lucayanum complex.

From: Phylogenetic position of a whale-fall lancelet (Cephalochordata) inferred from whole mitochondrial genome sequences

 

A. lucayanum complex sp. A

A. lucayanum complex sp. C

Position number

Size (bp)

Codon

anti-codon

Intergenic nucleotides

Position number

Size (bp)

Codon

anti-codon

Intergenic nucleotides

Features

From

To

start

stop

From

To

start

stop

cox1

1

1548

1548

GTG

TAA

 

34

1

1548

1548

GTG

TAA

 

43

cox3

1583

2371

789

ATG

TAG

 

15

1592

2380

789

ATG

TAA

 

13

nad3

2387

2740

354

ATG

TAG

 

8

2394

2747

354

ATG

TAG

 

11

trnS (UGA)

2749

2819

71

  

TGA

11

2759

2829

71

  

TGA

14

trnD

2831

2898

68

  

GTC

0

2844

2912

69

  

GTC

0

cox2

2899

3589

691

ATG

T--

 

0

2913

3603

691

ATG

T--

 

0

trnK

3590

3652

63

  

TTT

0

3604

3667

64

  

TTT

0

atp8

3653

3826

174

GTG

TAA

 

-7

3668

3841

174

GTG

TAA

 

-7

atp6

3820

4504

685

ATG

T--

 

0

3835

4519

685

ATG

T--

 

0

trnR

4505

4568

64

  

TCG

0

4520

4583

64

  

TCG

0

nad4L

4569

4843

275

ATG

TA-

 

0

4584

4858

275

ATG

TA-

 

0

nad4

4844

6202

1359

ATG

TAA

 

1

4859

6217

1359

ATG

TAA

 

1

trnH

6204

6269

66

  

GTG

0

6219

6284

66

  

GTG

0

trnS(GCU)

6270

6335

66

  

GCT

1

6285

6350

66

  

GCT

1

nad6

6337

6840

504

ATG

TAA

 

-15

6352

6855

504

ATG

TAA

 

-15

trnG

6826

6892

67

  

TCC

0

6841

6906

66

  

TCC

0

nad5

6893

8681

1789

ATG

T--

 

0

6907

8695

1789

GTG

T--

 

0

trnL (UAG)

8682

8749

68

  

TAG

6

8696

8762

67

  

TAG

9

trnE

8756

8819

64

  

TTC

5

8772

8836

65

  

TTC

4

cob

8825

9967

1143

ATG

TAA

 

0

8841

9983

1143

ATG

TAG

 

0

trnT

9968

10037

70

  

TGT

0

9984

10053

70

  

TGT

0

trnP

10038

10101

64

  

TGG

0

10054

10116

63

  

TGG

0

rrnS

10102

10943

842

   

0

10117

10964

848

   

0

trnF

10944

11006

63

  

GAA

0

10965

11027

63

  

GAA

0

trnV

11007

11073

67

  

TAC

0

11028

11094

67

  

TAC

0

rrnL

11074

12437

1364

   

0

11095

12460

1366

   

0

trnL(UAA)

12438

12506

69

  

TAA

0

12461

12530

70

  

TAA

0

nad1

12507

13449

943

GTG

T--

 

0

12531

13473

943

ATG

T--

 

1

trnI

13450

13515

66

  

GAT

15

13475

13540

66

  

GAT

20

trnW

13531

13598

68

  

TCA

9

13561

13629

69

  

TCA

3

trnA

13608

13670

63

  

TGC

3

13633

13695

63

  

TGC

2

trnC

13674

13727

54

  

GCA

0

13698

13752

55

  

GCA

0

trnY

13728

13792

65

  

GTA

12

13753

13818

66

  

GTA

42

trnM

13805

13871

67

  

CAT

-1

13861

13927

67

  

CAT

-1

trnQ

13871

13939

69

  

TTG

2

13927

13995

69

  

TTG

1

nad2

13942

14982

1041

ATG

TAA

 

-8

13997

15037

1041

ATG

TAA

 

-8

trnN

14975

15041

67

  

GTT

9

15030

15095

66

  

GTT

5

  1. Genes encoded on light strand of the mitogenome underlined.