Skip to main content

Advertisement

Table 1 Haplogroup and macrohaplogroup frequencies in the Near East and eastern-African populations1, gene diversity (H) with standard error (± s.e.) and percentage of number of haplotypes per sample size (K)

From: Eurasian and African mitochondrial DNA influences in the Saudi Arabian population

  Tuk Kur Irn Irq Syr Pal Drz Jor Bed Ara Yem Egy Sud Eth Ken
  494 212 712 116 119 118 45 145 29 120 214 126 159 344 99
Refs2 3,4,7,12,14,15,16 5,14,1516 6,13,14,15,16,20 1,16 18,19,20 18,20 16 20 16 20 9,16,18 10,17 10,20 9,18 2
CRS 0.14 0.11 0.08 0.07 0.06 0.07 0.02 0.10 - 0.03 0.03 0.06 0.01 - -
H/HV/R 0.09 0.04 0.05 0.07 0.09 0.12 0.02 0.05 0.07 0.02 0.04 0.04 0.04 0.02 -
H/HV/R 0.13 0.09 0.07 0.16 0.11 0.12 0.07 0.16 - 0.08 0.03 0.05 - - -
V 0.01 - 0.01 - 0.03 - - - - - - 0.01 0.02 - -
H/HV 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 - 0.02 0.01 - - - - - - -
HV 0.01 - 0.03 0.04 0.01 - - 0.01 - - 0.01 - - - -
HV1 0.02 0.02 0.01 - 0.02 0.01 0.09 0.02 - - 0.01 - 0.01 0.03 -
HV2 - - 0.02 0.01 - - - 0.01 - - 0.01 - - - -
HV/R 0.01 - 0.01 - - - - - - - - - - - -
(preHV)1 0.01 - 0.01 0.04 0.03 0.03 0.04 0.03 0.14 0.18 0.09 0.02 0.04 0.10 0.01
R - 0.01 0.01 - - - - - - - - - - - -
R2 - 0.01 0.01 0.01 0.03 - - 0.01 - - 0.01 - - - -
R5 - - 0.01 0.01 - - - - - - - - - - -
B - 0.01 0.01 0.01 - - - - 0.03 - - - - - -
F - - - - - 0.01 - - - - - - - - -
J 0.03 - 0.04 0.04 0.05 0.03 0.04 0.02 - 0.06 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01
J1 0.02 0.02 0.04 0.03 0.01 0.02 - 0.01 0.03 0.03 0.04 - - - -
J1a - 0.01 - - 0.01 0.01 0.02 0.01 - - - - - - -
J1b 0.01 0.02 0.03 0.04 0.01 0.02 - 0.01 0.14 0.12 0.04 0.02 - - -
J1b1 0.01 - - - - - - - - - - - - - -
J1d 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 0.03 - - 0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 -
T 0.04 0.08 0.04 0.03 0.04 0.04 - 0.01 - 0.01 - 0.02 0.01 0.01 -
T1 0.03 0.02 0.03 0.04 0.03 0.03 0.04 0.01 0.03 0.01 0.01 0.07 0.01 0.02 -
T2 - - 0.01 0.01 0.03 0.02 - 0.03 - - - 0.02 - 0.01 -
T3 0.01 0.01 0.01 - 0.01 0.02 - 0.02 - 0.03 - 0.02 - 0.01 -
T4 - - - - - 0.01 - - - - - 0.02 - - -
T5 - - - - 0.01 0.01 - - 0.03 0.02 - 0.01 - - -
U 0.02 - - 0.02 - - - 0.01 - - 0.01 - - - -
U1 - - - - - - - - - - - - - - -
U1a 0.04 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.07 0.01 0.07 0.01 0.01 0.01 - - -
U1b 0.01 - - - 0.03 - - 0.02 - 0.01 - - - - -
U2b - - - - - - - - - - 0.01 - - - -
U2d - - - - - 0.01 - 0.01 - - - - - 0.01 -
U2e 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 - 0.01 - 0.01 - - - - -
U3 0.05 0.03 0.03 0.06 0.07 0.01 - 0.16 0.03 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 -
U4 0.01 - 0.01 0.02 0.03 0.02 - 0.01 - - - 0.02 - - -
U5 - - - - - - - - - - - 0.01 - - -
U5a1 0.01 0.02 0.01 - 0.01 - - 0.01 - - - - - - -
U5a1a 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 - - - 0.01 0.01 - - - -
U5b 0.01 - - - - - - - - - - 0.01 - - -
U6a - - - 0.01 - 0.01 - - - 0.01 - - - - -
U6a1 - - - - 0.03 - - - - - - 0.01 - 0.03 0.01
U6b - - - - - - - - 0.07 - - - - - -
U7 0.01 0.06 0.07 0.03 0.03 0.03 - - - - - 0.01 - - -
U8b 0.01 0.01 0.01 - - - - 0.01 - 0.01 - - - - -
U9 - - - - - - - - - 0.03 - - - - -
K 0.05 0.11 0.06 0.05 0.06 0.08 0.20 0.03 - 0.06 0.05 0.02 0.01 0.01 -
A 0.01 - - - 0.01 - - - 0.03 - - - - - -
N2a - - 0.01 - - - - 0.01 - - - - - - -
N9 - - - - - - - - - - - - - - -
Y1 - - - - - - - - - - - 0.01 - - -
N1a - - - - - - - - - 0.04 0.04 0.02 - 0.02 -
N1b 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.03 0.03 - 0.05 - - -
N1c - 0.01 - - - 0.02 0.02 - - 0.02 - - - - -
W 0.02 0.04 0.02 - 0.03 0.02 - 0.01 - 0.01 - 0.01 0.01 0.01 0.01
X 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.04 0.27 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 -
I 0.01 0.01 0.01 - - - 0.02 0.02 - 0.01 - 0.02 - 0.01 -
N - - 0.01 - - - - 0.01 - - - - - - -
I/M/L 0.01 0.02 0.02 - - - - - - - - 0.02 - 0.01 -
N/L/M 0.03 - 0.02 - - 0.02 - 0.01 0.03 - 0.01 0.02 0.08 0.01 0.03
M - - 0.01 0.01 - - - - - 0.02 0.02 0.02 - - -
M1 - - - - - - - 0.01 0.03 0.01 - 0.05 0.03 0.08 0.02
M1a - - - - - 0.02 0.02 0.01 0.03 0.03 0.01 0.05 0.04 0.07 0.02
M3 - - 0.01 - - - - - 0.03 0.01 0.02 - - - -
Z - - - - - - - - - - - - - - -
C 0.01 0.02 0.01 - - - - - - - - - - - -
G - - 0.01 - - - - - - - - - - - -
M/D 0.02 - 0.01 - - - - - - - - 0.02 0.01 - -
D 0.01 - - - - - - - - - - - - - -
L* - - - - - 0.01 - 0.01 - - - 0.01 - - 0.03
L3b - - - - - 0.01 - 0.03 - - 0.01 0.01 0.02 - 0.06
L3d - - - - - 0.03 - 0.01 - 0.01 0.04 - 0.01 0.03 -
L3e1 - - - - - 0.01 - - - - - 0.01 - - 0.05
L3e2 - - - - 0.01 0.01 - - - - - - - - 0.02
L3e3 - - - - - 0.02 - - - - 0.02 - - - 0.03
L3e4 - - - - 0.01 - - - - - - - 0.01 - -
L3e5 - - - - - - - - - - 0.01 - - - -
L3f - - - - 0.01 - - - - 0.01 - - 0.04 0.02 0.05
L3f1 - - - 0.02 - - - 0.01 - - 0.02 - 0.03 0.03 0.03
L3h - - - - - 0.01 - - - 0.02 - - 0.03 0.01 0.04
L3i - - - - - - - - - 0.01 0.01 - - 0.01 -
L3i/N2a - - - - - - - - - - - 0.02 0.05 - -
L3w - - - - - - - 0.01 - - - - - 0.03 0.01
L3x1 - - - - - - - - - - - - - 0.03 0.01
L3x2 - - - - - - - 0.01 - - - 0.02 - 0.01 -
L4a - - - - - - - - - - 0.01 - - 0.01 -
L4a1 - - - - - - - - - - - - 0.01 0.04 0.02
L4g - - - - 0.01 0.01 - - - - - 0.01 0.03 0.03 0.14
L2a/L2c - - - - - - - 0.01 - - 0.01 0.02 0.08 0.01 0.03
L2a1 - - - 0.04 0.02 0.03 - 0.01 - - 0.01 0.02 0.07 0.05 0.03
L2a1a - - - - - 0.01 - - - 0.01 0.03 - - - -
L2a1b3 - - - - - 0.01 - - 0.03 - - 0.01 0.01 0.03 0.02
L2a2 - - - - - - - - - 0.01 - 0.01 0.03 0.02 -
L2a3 - - - - - - - - - - - - 0.04 - -
L2b - - - - - - - - - - - 0.01 0.01 0.02 -
L2c2 - - - - - - - 0.01 - 0.01 - - - - -
L2d - - - - - - - - - - 0.01 - 0.01 - 0.01
L6 - - - - - - - - - - 0.07 - - 0.01 -
L5a1 - - - - - - - - - - - 0.02 0.01 0.01 0.01
L5a2 - - - - - - - - - - - 0.02 0.03 0.01 0.01
L5b - - - - - - - - - - - - - 0.01 -
L1b - - - - - - - - - - - 0.01 0.01 - 0.01
L1b1 - - - - 0.01 - - 0.01 - - - - 0.03 0.03 0.01
L1c - - - 0.02 - - - - - - 0.01 - 0.01 - 0.02
L1e - - - - - - - - - - - - - - 0.01
L0a - - - - - - - - - - - - 0.01 0.01 0.02
L0a1 - - - - 0.01 0.01 - 0.01 0.03 - 0.02 0.05 0.09 0.04 0.05
L0a1a - - - - - - - 0.01 - - - 0.01 0.01 - 0.03
L0a2 - - - 0.01 - - - - - - 0.04 - 0.01 0.01 0.05
L0f - - - - - - - - - - - - 0.01 - 0.08
L0k - - - - - - - - - - 0.01 - - - -
L 0.01 0.01 - 0.09 0.07 0.14 - 0.12 0.07 0.07 0.37 0.22 0.65 0.51 0.89
M 0.04 0.04 0.05 0.01 - 0.02 0.02 0.03 0.10 0.07 0.06 0.13 0.08 0.15 0.04
N 0.09 0.11 0.11 0.03 0.06 0.08 0.33 0.07 0.10 0.12 0.07 0.11 0.01 0.05 0.01
R 0.82 0.82 0.80 0.87 0.87 0.74 0.64 0.77 0.69 0.75 0.49 0.48 0.18 0.27 0.03
others 0.03 0.02 0.04 - - 0.02 - 0.01 0.03 - 0.01 0.05 0.08 0.01 0.03
H 0.979 0.984 0.990 0.992 0.995 0.995 0.946 0.978 0.995 0.986 0.989 0.993 0.989 0.993 0.995
± s.e. 0.004 0.004 0.002 0.004 0.003 0.003 0.019 0.006 0.011 0.004 0.002 0.003 0.003 0.001 0.002
81 56 67 80 53 64 93 67 56 86 83 80 60 65 63 K (%)
  1. 1 Population abbreviations: Tuk Turkey, Kur Kurds, Irn Iran, Irq Iraq, Syr Syria, Pal Palestine, Drz Druze, Jor Jordanian, Bed Bedouin, Ara Saudi Arabs, Yem Yemen, Egy Egypt, Sud Sudan, Eth Ethiopia, Ken Kenia.
  2. 2 Data source references are detailed in [see Additional file 2].