Skip to main content

Advertisement

Table 1 The summary of genetic diversity in Saccharina japonica

From: Phylogeographic data revealed shallow genetic structure in the kelp Saccharina japonica (Laminariales, Phaeophyta)

POP N COI trnW-L COI + trnW-L
S Pi Hd h S Pi Hd h S Pi Hd h
Japan 231 19 0.00067 0.47149 15 16 0.00131 0.39029 16 35 0.00079 0.72528 30
1 27 5 0.00041 0.44160 5 3 0.00113 0.33333 4 8 0.00055 0.50427 7
2 6 1 0.00035 0.53333 2 0 0.00000 0.00000 1 1 0.00028 0.53333 2
3 22 0 0.00000 0.00000 1 2 0.00050 0.17749 3 2 0.00010 0.17749 3
4 10 2 0.00047 0.35556 2 2 0.00110 0.37778 3 4 0.00059 0.64444 4
5 24 2 0.00056 0.43116 2 1 0.00023 0.08333 2 3 0.00050 0.48913 3
6 21 1 0.00006 0.09524 2 1 0.00071 0.25714 2 2 0.00019 0.33810 3
7 28 8 0.00191 0.68254 5 1 0.00039 0.14021 3 10 0.00162 0.74339 7
8 26 2 0.00026 0.38462 3 1 0.00021 0.07692 2 3 0.00025 0.39692 4
9 7 0 0.00000 0.00000 1 3 0.00421 0.76190 3 3 0.00081 0.76190 3
10 28 0 0.00000 0.00000 1 1 0.00140 0.50794 2 1 0.00027 0.50794 2
11 32 1 0.00021 0.31452 2 1 0.00134 0.48387 2 2 0.00042 0.55645 3
Russia 267 16 0.00009 0.10935 14 9 0.00159 0.52984 9 25 0.00038 0.58537 22
12 28 1 0.00005 0.07143 2 2 0.00039 0.14021 3 3 0.00011 0.20635 4
13 24 2 0.00011 0.16304 3 1 0.00023 0.08333 2 3 0.00013 0.23913 4
14 29 2 0.00013 0.19704 3 0 0.00000 0.00000 1 2 0.00011 0.19704 3
15 28 2 0.00009 0.14021 3 2 0.00090 0.31481 3 4 0.00025 0.38095 5
16 21 2 0.00012 0.18571 3 1 0.00026 0.09524 2 3 0.00015 0.27143 4
17 30 1 0.00004 0.06667 2 3 0.00139 0.38391 3 4 0.00030 0.39540 4
18 16 1 0.00008 0.12500 2 1 0.00035 0.12500 2 2 0.00013 0.24167 3
19 26 1 0.00005 0.07692 2 2 0.00042 0.07692 2 3 0.00012 0.15077 3
20 29 5 0.00023 0.13547 3 0 0.00000 0.00000 1 5 0.00018 0.13547 3
21 30 0 0.00000 0.00000 1 0 0.00000 0.00000 1 0 0.00000 0.00000 1
22 6 0 0.00000 0.00000 1 2 0.00331 0.60000 2 2 0.00063 0.60000 2
Korea 27 5 0.00033 0.33333 4 0 0.00000 0.00000 1 5 0.00027 0.03333 4
23 27 5 0.00033 0.33333 4 0 0.00000 0.00000 1 5 0.00027 0.03333 4
China 87 1 0.00028 0.43304 2 3 0.00146 0.49051 3 4 0.00051 0.55306 5
24 27 0 0.00000 0.00000 1 0 0.00000 0.00000 1 0 0.00000 0.00000 1
25 30 0 0.00000 0.00000 1 3 0.00149 0.42069 3 3 0.00028 0.42069 3
26 30 1 0.00012 0.18621 2 1 0.00066 0.23908 2 2 0.00023 0.24598 3
Total 612 35 0.00043 0.40824 30 20 0.00191 0.56200 22 55 0.00072 0.72165 53
  1. N number of sequences, S number of segregating sites, Pi nucleotide diversity, Hd haplotype diversity, h number of haplotypes in each population. The bold indicated that the summary genetic diversity of all populations in this regions